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NEBNext FFPE DNA 修复混合液
NEBNext FFPE DNA Repair Mix
NEBNext FFPE DNA 修复混合液包含经过优化的酶和缓冲液,可在二代测序流程中修复 FFPE DNA。该混合液可用于任何二代测序文库制备流程的上游,适用于所有测序平台。

表 1:FFPE DNA 的损伤类型及 NEBNext FFPE DNA 修复混合液的修复能力

图 1:FFPE DNA 修复提高了 NGS 文库产量
在构建文库之前,用 FFPE DNA 修复混合液处理胃癌 FFPE DNA,然后将处理过的样本和未处理的样本同时建库,再用 Agilent Bioanalyzer® 进行建库分析,结果显示,文库产量提高 101-458%。

图 2:FFPE DNA 修复提高了 NGS 文库产量
在建库之前,用 FFPE DNA 修复混合液处理不同组织类型的 FFPE DNA 样本(25 ng 和 50 ng),然后将处理过的样本和未处理的样本同时建库。使用 Agilent Bioanalyzer 测定文库产量,并计算 NEBNext FFPE DNA 修复混合液处理前后文库产量的比值。结果显示,产量提高 101-458%。

图 3:FFPE DNA 修复混合液可提高 FFPE 样本的序列质量且不会产生新的突变
使用标准 DNA 纯化法提取基因组 DNA。在建库和进行 Illumina® 测序之前,使用或不使用 NEBNext FFPE DNA 修复混合液处理 DNA 样本。
图 A:DNA 修复对可比对 read 百分比的影响。使用 BWA(1)将 read 与人类基因组(hg19)进行比对。
图 B:DNA 修复对双端测序操作流程中正确配对的 read 百分比的影响。

存储条件:-20℃。
| 货号 | 产品名称 | 单位 | 购买 |
|---|---|---|---|
| E7630L | NEBNext® 文库定量试剂盒 | 500 rxns | 商城订购 |
| M0348S | NEBNext DNA 双链片段化酶 | 50 rxns | 商城订购 |
| E7335L | NEBNext 多样本接头引物试剂盒 - Illumina(检索引物试剂盒 1) | 96 rxns | 商城订购 |
| 244-PCR-C-0.2-BAG | 0.2ml PCR管 | 1000 个/包 | 商城订购 |
| 4381 | 0.1-2ul单道移液器 | 1 unit | 商城订购 |
| 4382 | 0.5-10ul单道移液器 | 1 unit | 商城订购 |
| 221-R-C-10S | 0.5-10ul 盒装灭菌吸头 | 96支/盒,10盒/组,5组/箱 | 商城订购 |
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