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NEBNext FFPE DNA 修复混合液

NEBNext FFPE DNA Repair Mix

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NEBNext FFPE DNA 修复混合液包含经过优化的酶和缓冲液,可在二代测序流程中修复 FFPE DNA。该混合液可用于任何二代测序文库制备流程的上游,适用于所有测序平台。


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表 1:FFPE DNA 的损伤类型及 NEBNext FFPE DNA 修复混合液的修复能力


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图 1:FFPE DNA 修复提高了 NGS 文库产量

在构建文库之前,用 FFPE DNA 修复混合液处理胃癌 FFPE DNA,然后将处理过的样本和未处理的样本同时建库,再用 Agilent Bioanalyzer® 进行建库分析,结果显示,文库产量提高 101-458%。


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图 2:FFPE DNA 修复提高了 NGS 文库产量

在建库之前,用 FFPE DNA 修复混合液处理不同组织类型的 FFPE DNA 样本(25 ng 和 50 ng),然后将处理过的样本和未处理的样本同时建库。使用 Agilent Bioanalyzer 测定文库产量,并计算 NEBNext FFPE DNA 修复混合液处理前后文库产量的比值。结果显示,产量提高 101-458%。


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图 3:FFPE DNA 修复混合液可提高 FFPE 样本的序列质量且不会产生新的突变

使用标准 DNA 纯化法提取基因组 DNA。在建库和进行 Illumina® 测序之前,使用或不使用 NEBNext FFPE DNA 修复混合液处理 DNA 样本。

图 A:DNA 修复对可比对 read 百分比的影响。使用 BWA(1)将 read 与人类基因组(hg19)进行比对。

图 B:DNA 修复对双端测序操作流程中正确配对的 read 百分比的影响。


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货号 产品名称 单位 购买
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