info@genecompany.com| 基因快讯|
商城基因
登录

当前位置：首页 > 产品中心

产品中心



技术交流

扫描二维码
或添加“GeneGroup003”
获取更多更新资讯

商城订购

扫描二维码
或添加“基因商城（GeneMart）”
手机下单，快人一步

售后服务

扫描二维码
或添加“GeneGroup005”
获取更快速售后支持

NEBNext® 酶学转化法甲基化建库试剂盒 v2

NEBNext® Enzymatic Methyl-seq v2 Kit

产品概述 技术指标 配套产品 订购信息 精彩视频 相关资料
NEBNext酶法甲基化测序（EM-seq™）是一种高性能的酶法替代重亚硫酸盐转化的方法，用于识别5mC和5hmC。与重亚硫酸盐转化不同，这种方法效率极高，DNA损伤极低，从而能够以更少的reads数实现对甲基化胞嘧啶的优越检测。

新的NEBNext酶法甲基化测序v2试剂盒具有更宽的起始量范围（低至100 pg），并且比EM-seq试剂盒（NEB #E7120）具有更快、更简化的操作流程。

NEBNext酶法甲基化测序v2试剂盒包括转化试剂、文库制备试剂和EM-seq接头。
EM-seq是一种两步酶法转化过程，用于检测修饰胞嘧啶。

在第一步中，TET2和T4-BGT保护修饰胞嘧啶免受下游脱氨基作用。TET2酶促氧化5mC和5hmC，而T4-BGT糖基化5hmC。

第二步酶法步骤使用APOBEC将未修饰胞嘧啶脱氨基为尿嘧啶，但在第一步中受保护的5mC和5hmC不会被脱氨基。

随后使用NEBNext预混液Q5U®（Q5®高保真DNA聚合酶的改良版本）进行扩增，并在Illumina平台上进行测序。EM-seq操作持续高效的转化表现以及最小化的DNA损伤，结合高效的Ultra II文库构建方法，使得在较少的测序读取量下也能实现对CpG位点的卓越检测。

所需的索引引物（NEBNext LV Unique Dual Index Primers）可单独购买，提供更大的多重检测灵活性。

产品优势：
1、对5mC和5hmC检测的优越灵敏度
2、0.1 ng - 200 ng输入范围
3、以更少的测序读数检测更多的CpG位点
4、均匀的GC覆盖
5、高性能文库制备和更大的文库插入片段大小
6、索引引物单独提供
7、与EM-seq工作流程兼容的DNA酶法片段化可以通过NEBNext UltraShear®（NEB #M7634）实现。

仅用于转化，NEBNext酶法甲基化测序v2转化模块（NEB #E8020）也可提供。
对于特定检测5hmC，NEBNext酶法E5hmC-seq试剂盒（NEB #E3350）可提供。

图1：EM-seq™转化方法
EM-seq™ v2工作流程比原始EM-seq工作流程具有更宽的输入范围，最低输入量降低了100倍。v2工作流程更加简化，减少了一步清洁步骤，速度更快。请注意，NEBNext LV UDI引物不包含在试剂盒中，需单独购买。

图2：EM-seq™ v2在不同输入量下展现出高CpG覆盖度
使用200–0.1 ng的NA12878 DNA（使用Covaris® ME220剪切至350 bp），并掺入未甲基化的lambda DNA和CpG甲基化的pUC19 DNA，制备EM-seq™ v2文库。文库在Illumina® NovaSeq® 6000上进行测序（2 x 150碱基）。每个文库大约有9.1亿条读数，使用bwa-meth比对到一个人类T2T、lambda和pUC19的复合参考基因组。当分别计算正负链时，T2T基因组最多覆盖6780万个CpG位点。EM-seq对200–1 ng输入量的文库覆盖了超过5600万个CpG位点，对0.1 ng输入量的文库大约覆盖了4500万个CpG位点。

图3：NEBNext EM-seq v2在较低的测序覆盖深度下识别出比WGBS和原始EM-seq更多的CpG位点
使用200 ng和10 ng的NA12878 DNA（剪切至约350 bp），并掺入未甲基化的lambda DNA和CpG甲基化的pUC19 DNA，制备EM-seq v2（NEB #E8015）、EM-seq（NEB #E7120）和WGBS文库。文库在Illumina NovaSeq 6000上进行测序。为了准确比较原始EM-seq和WGBS数据与EM-seq v2数据，我们评估了每个文库大约6.25亿条100碱基读数，使用bwa-meth比对到一个人类T2T、lambda和pUC19的复合参考基因组。

当分别计算正负链时，T2T基因组最多覆盖6780万个CpG位点。EM-seq v2和EM-seq在200 ng和10 ng输入量下均覆盖了超过5400万个CpG位点；然而，WGBS文库在1X覆盖度下，200 ng和10 ng输入量分别仅覆盖了4600万和3900万个CpG位点。虚线表示（A）10X和（B）8X的覆盖度。表格列出了不同文库在（A）10X和（B）8X覆盖水平下覆盖的CpG位点的百分比。

图4：EM-seq™ v2在广泛的输入范围内产生高文库产量
使用200–0.1 ng的NA12878基因组DNA（使用Covaris® ME220剪切至350 bp）作为EM-seq™ v2协议的输入，并使用所示的PCR循环数。使用Agilent® TapeStation®与High Sensitivity D1000试剂测定文库产量。所示值为两个技术重复的平均值，误差条表示标准差。EM-seq v2在广泛的输入范围内始终产生高产量文库。

图5：EM-seq™ v2提供均匀的GC覆盖
使用200–0.1 ng的NA12878 DNA（使用Covaris® ME220剪切至350 bp），并掺入未甲基化的lambda DNA和CpG甲基化的pUC19 DNA，制备EM-seq™ v2文库。文库在Illumina® NovaSeq® 6000上进行测序（2 x 150碱基）。每个文库大约有9.1亿条读数，使用bwa-meth比对到一个人类T2T、lambda和pUC19的复合参考基因组。使用Picard分析GC覆盖，并绘制了映射到人类基因组的读数在不同GC含量（0–100%）的基因组上的标准化覆盖分布。EM-seq v2文库在整个输入范围内具有均匀的GC覆盖。
存储条件：-20℃
货号 产品名称 单位 购买
货号 名称 单位 购买
E8015S NEBNext® 酶学转化法甲基化建库试剂盒 v2 商城订购
E8015L NEBNext® 酶学转化法甲基化建库试剂盒 v2 商城订购
    彩页：
    操作指南：
    相关文献：
索取更多资料

新闻促销活动

相关产品

获得帮助

  • 发送简短提问电子邮件
  • 联系您身边的基因员工
  • 获取产品支持
  • 询价
本网页所展示产品仅限于科研用途，不可用于诊断或治疗。产品信息可能存在更新滞后的情况，请一切以厂家官方说明及实物为准。


欢迎关注我司“基因快讯”与“基因售后服务”官方微信

仪器报修 试剂售后 配套耗材/试剂订购 技术支持
售后服务 订购指南

未经书面授权，所有页面内容、图片和设计不得以任何形式进行复制
Copyright © 2016 genecompany,All Rights Reserved
上海市闵行区浦星公路789号1幢5层 电话：021-58682790
隐私政策 法律声明

沪公网安备 31011202014103号

 沪ICP备2022000693号-1

\r\n\n", 3,$destination); ?>