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PacBio Sequel IIe单分子实时测序系统
PacBio Sequel IIe System
PacBio Sequel IIe 采用单分子实时(Single Molecule,Real-Time,SMRT®)测序技术。通过从数百万个零模波导孔中,对原始的长片段DNA进行天然的DNA复制,收集相应的数据差从而完成测序的过程。
SMRT测序的原理
SMRT测序的优势
什么是HiFi Reads?
采用环形一致性测序 (Circular Consensus Sequencing,CCS) 技术生成的 HiFi reads,包含丰富的数据,帮助您解释诸多复杂的生物学问题。
有了 PacBio® HiFi reads,您不再需要在长读长测序和高精度测序之间折衷。
HiFi Reads的优势
√ 读长可长达 25 kb
√下机数据准确率 >99.9%
√ 简单的建库流程
√ 低基因组覆盖度要求
√ 数据文件精简,最大程度缩短计算时间
√ 仅使用一个技术解决方案即可满足多种应用需求
√ 出色的数据清晰度,可进行快速解析
SMRT测序的应用
大小:W 92.7m×D 91.4cm×H 167.6cm
重量:362kg
环境温度:19ºC – 25ºC ± 2°C per hour
湿度:20% – 80%, 非冷凝
单张芯片上ZMW小孔数量:800万个
具有以下性能:
无于伦比的高准确度长读长测序
PacBio提供高度准确的长读长的测序技术(HiFi Reads),在读长达到15-20 kb的情况下,可提供Sanger测序相当的准确度(> 99%),满足组装复杂基因组的需要,可检测从单核苷酸突变到结构变异的各种基因组变异。
PacBio使用环形一致性测序(CCS)模式产生HiFi Reads,以提供具有> 99.9%单分子读取准确度的碱基水平分辨率。
单分子实时检测
无需PCR扩增,避免PCR引入的系统误差及对扩增片段的偏好性引起的信息缺失。
每一条模板链都可获得相应序列信息,数据覆盖均匀、准确;
还可以检测包括稀有变异在内的各种突变型,反映各种突变型的频率。
覆盖深度几乎不受序列中GC含量差异的影响
可测定高GC含量的区域,高度重复片段区域,100% A+T序列等基于模板PCR的测序技术难以逾越的区段。
可同时获得聚合酶反应动力学信息,进行甲基化等修饰碱基的直接测定,还可区分不同基团的甲基化修饰及其它碱基修饰。
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