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ChIP、CUT&RUN、CUT&Tag怎么选？4张图帮你秒懂！
蛋白质-DNA相互作用研究是表观遗传学的核心课题。面对ChIP、CUT&RUN、CUT&Tag这三种主流技术，很多小伙伴都犯了选择困难症：样本量不够怎么办？想做qPCR选哪个？时间紧迫怎么破？ 今天就带你用4个维度，快速锁定最适合的技术方案！ Step 1：先看你的样品/靶标类型是什么？ 组蛋白修饰：三种技术均可 细胞样品的转录因子和辅因子：三种技术均可 一般组织和纤维化组织的转录因子/辅因子：ChIP和CUT&RUN通用性更强；CUT&Tag仅支持部分靶标（需提前确认抗体适用性） Step 2：样本量够吗？ 样本充足（细胞400万+/组织25mg+）：三种任选，ChIP最经典 样本珍贵/少量（细胞5千-25万/组织1-5mg）：首选CUT&RUN或CUT&Tag，ChIP需要大量细胞 Step 3：下游怎么检测？ 想做qPCR验证：锁定ChIP或CUT&RUN，CUT&Tag不支持qPCR，只能上机测序 计划高通量测序（NGS）：三种均可，但CUT&Tag所需测序数据量最少（仅2M），最省钱 Step 4：赶时间吗？ 极速出结果：CUT&Tag（1-2天即可完成建库） 常规周期：CUT&RUN（2-3天） 经典但较慢：ChIP（4-5天，步骤繁琐但最稳健） 💡 样本极少 + 要测序 + 赶时间 = CUT&Tag 💡 样本中等 + 要qPCR and/or要测序 = CUT&RUN 💡 样本充足 + 要qPCR and/or 要测序 + 最稳健 = ChIP 💡 转录因子/辅因子不确定能不能做 = 先排除CUT&Tag，选ChIP/CUT&RUN ChIP、CUT&RUN，CUT&Tag这三种技术，其实是互为补充，相辅相成的关系。根据具体情况选择哪一种或互相结合，都可以为我们带来某一方面或者更全面更深入的研究成果。 特别提醒：ChIP的验证抗体库最丰富，而CUT&Tag虽然"又快又省"，但对转录因子和辅因子的兼容性及抗体选择相对有限，务必提前确认抗体是否经过验证哦！ Cell Signaling Technology (CST) 同时提供包含ChIP、CUT&RUN，CUT&Tag在内的全面的染色质分析产品组合。为您如何探索蛋白质-DNA 相互作用，提供更多选择！ 除了ChIP、CUT&RUN、CUT&Tag分析试剂盒，CST还提供相关试剂以及经严格验证的ChIP/CUT&RUN/CUT&Tag级别抗体；您可根据您的实验需求灵活选择完整的检测试剂盒或只订购您所需的试剂或抗体。 选对技术，实验事半功倍！赶紧收藏这篇，下次做实验前翻出来对照一下~ 如果您对这几种技术感兴趣，欢迎添加 如下技术人员微信了解更多信息！ 基因有限公司作为CST在中国区的长期合作伙伴，将持续为您提供优质的产品、专业的技术支持与完善的售后服务。
