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PacBio HiFi测序 专业术语简介
揭秘 PacBio 测序中的专业术语
HIFI 原理与表现
HIFI 数据表现
这是人类基因组DNA样品构建的15kb长度文库下机数据结果。HIFI 平均读长 15kb。
文库结构 SMRTbell
SMRTbell 哑铃型结构 —— 双链DNA 两端会连接上发夹结构的接头（Adapter）
以下视频来源于
基因售后服务
Polymerase Reads / Subreads / CCS Reads / HIFI Reads
1
Polymerase Read
Polymerase read —— 在有效ZMW孔中，由聚合酶合成的核苷酸序列。仅含高质量（HQ） 区域，包括接头序列和文库序列。
2
Subreads
Subreads —— 去除接头分子后的文库序列。
3
CCS Reads
CCS reads —— 由每个ZMW 孔内产生的 Subreads 所生成的一致性序列 （Circular Consensus Sequencing reads）。
4
HiFi Reads
HIFI reads —— 准确率≥Q20的CCS reads。
什么是 P0/P1/P2 ？
目前用于Revio的SMRT Cell测序芯片，具有2500万个ZMW孔；
Sequel II/IIe的SMRT Cell 8M 测序芯片，具有800万个ZMW孔。
ZMW 孔 : Zero-Mode Waveguides，零模波导孔 ，直径100nm。
P0 (“空 ZMW”) ：
ZMW孔没有产生任何有效数据 —— 没有采集到有效荧光信号。
P1（“有效 ZMW”）：
能生成有效序列数据（即Polymerase Reads）的ZMW孔。
P2（“其他 ZMW”）：
没有生成有效序列数据的ZMW 孔 —— 即非P0 / P1 的情况。可能是由于 ZMW 中结合了多个模板-聚合酶复合物，或具有高背景噪声等。
以上是关于PacBio HiFi 测序的一些基本概念，希望对各位老师有所帮助。
请持续关注我们，敬请期待下一篇哦！
基因有限公司作为PacBio中国区代理商，自2011年以来将PacBio第三代单分子实时测序技术引入国内，一直为国内用户提供专业的三代测序系统的安装培训，技术支持，应用培训与售后维护工作，赢得客户的一致好评与信任。基因有限公司将一如既往的支持越来越多的PacBio用户。
关于基因 基因有限公司成立于1992年，是一家提供生命科学科研仪器、试剂耗材和技术服务的综合服务商。基于“Gene Brightens Every Life • BioTech Connects the World”——“基因燃亮生命 • 生物技术连接世界”的愿景，专注于生命科学领域前沿技术的引进和推广，致力于推动该领域国内科研机构硬件水平及实验方案的革新与升级。同时，公司也一直致力于自主品牌的科研设备的研发与生产，拥有一系列通用性强、互补性高的自主品牌产品。 基因的服务网络遍及全国各地十多个大中城市，拥有包括仪器销售，试剂销售，市场与技术支持，维修，客服，物流等多个部门组成的完整服务体系。 我们希望通过不懈努力，为您的成功铺路搭桥，也为中国的生命科学事业赶超世界先进水平尽一己之力。欲了解更多信息，请访问www.genecompany.cn。
