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用过这些微生物核酸抽提助力工具吗?
土壤、粪便、水环境等微生物种群研究,很多时候会涉及到微生物核酸,如何从这些样本中得到高质量DNA?下面给大家介绍几款助力工具,您认识几个?
01
散装碾磨珠
碾磨珠用于样本的充分破碎,核酸的完全释放。经过碾磨珠破碎后的样本,核酸得率更高、核酸更丰富。
下方是来自客户处的微生物DNA提取结果。
方法:分别使用来自T品牌和MN 品牌的微生物DNA提取试剂盒,处理相同上样量的微生物。核酸洗脱液体积和凝胶电泳上样体积相同,其它步骤完全按照试剂盒说明书执行。
结论:
琼脂糖凝胶电泳结果
通过凝胶结果可以初步判断,MN试剂盒纯化的核酸浓度高于T品牌试剂盒纯化的核酸。
分析:
较大差异的提取得率很可能来源于MN提取试剂盒含有碾磨珠,实现微生物样本化学裂解和物理破碎相结合,样本破碎充分。
不同的样本来源适用的碾磨珠也不同,下方是适配表格。
02
管装碾磨珠
有些品牌的土壤、粪便、水体等核酸纯化试剂盒里面配套了可用的管装碾磨珠,只需要将待破碎的样本和裂解液加入管内即可。比如NucleoSpin Microbial DNA Mini kit,配套 了MN Bead Tubes Type B。
03
单管碾磨珠hoder
碾磨珠、样本和裂解液混合之后,就要借助外力充分研磨。提供外力的设备为涡旋仪,比如Vortex-Genie® 2。如何让管子结实的附在仪器上呢?MN hoder解决了此问题。hoder底部可以和vortex顶部牢牢固定在一起。一次可以匀浆12管样本。
04
96孔板碾磨珠
96孔板碾磨珠可兼容swing mill 机器,比如mixer mill MM300 from Retsch®,一次可完成96个样本均浆。
05
抑制剂去除柱
粪便样本因其复杂的组份,一般裂解液澄清和洗涤,不能完全的去除掉核酸里面的抑制剂组份,进而影响qPCR结果。这类样本需要专门的抑制剂去除柱Inhibitor Removal Column处理掉样本中的抑制剂组份。
06
NucleoVac 96 Vacuum Manifold
不依赖高通量核酸抽提仪器的高通量核酸提取方式。一个真空抽滤泵、一个真空抽滤装置、再另加一个柱膜核酸抽提试剂盒,即可以轻松的完成核酸的96孔板形式的高通量抽提。相比高通量核酸抽提仪器为平台的抽提方式,会省下很大一笔购买仪器设备的费用。
MN 微生物核酸抽提试剂盒列表:
基因有限公司作为MACHEREY-NAGEL的全国一级代理,可为您提供针对不同类型样本,例如血液、组织细胞、植物、真菌、土壤、粪便等的DNA和RNA核酸抽提解决方案。