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如何实现大片段DNA的电泳和分析

版权所有,转载请联系基因市场部
2020-07-30

小知识

许多进行基因组研究的方法,如长读长测序、BAC文库构建、合成生物学等都涉及大片段DNA的质控或分析,而实现片段质控或分析最常用的方法就是电泳。

普通凝胶电泳在DNA分离时,由于大分子量DNA分子移动速度接近,条带很难区分开。脉冲场电泳技术通过不断转换电场方向可以有效实现大片段DNA的分离。因为在电场转换后,分子量相对小的分子可以较快转变移动方向,而较大的分子在凝胶中转向较为困难。因此,分子量相对小的分子向前移动的速度比大分子快,大片段DNA就可以有效分离开。

传统的脉冲场电泳多为手工操作,步骤繁琐且电泳耗时长。Agilent Femto Pulse自动化毛细管脉冲场电泳系统将毛细管电泳和脉冲场电泳结合在一起,利用平行毛细管以及通过交替转换电压正负极性来实现对大片段DNA的自动化、高通量、快速电泳和分析。

Femto Pulse不仅可以获得凝胶图、峰图,还可以实现用户自定义的快速结果分析。


自动化、高通量、速度快

Femto Pulse采用12道并行毛细管,12个泳道同时进行检测。可同时容纳3块96孔样品板,在无人值守的情况下,可一次性实现288个样品的分离。

传统脉冲场电泳其电泳时间一般为16-24h,而Femto Pulse仅需约1.5小时即可实现高达165kb的高分子量DNA的分离。

大片段分离、准确分子量测定及质量评估

Femto Pulse可准确实现长达165kb的DNA的分离和分子量测定。


 GQN(Genomic Quality Number) 可根据用户自定义条件对基因组DNA进行质量评估。如下图,该基因组DNA的平均smear大小为173648bp,GQN50kb为9.4,代表有94%的DNA片段分子量大于50kb(50kb为用户自定义条件)。

高灵敏度

Fragment检测,上样DNA浓度低至50fg/μL

Smear检测,上样DNA浓度低至5pg/μL。 

基因有限公司作为Agilent自动化电泳产品线的中国区代理商,为您提供专业的产品咨询和技术支持。欲了解详情,请扫描下方二维码,将有技术人员一对一为你答疑解惑~




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