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做转染实验,别忽视质粒中内毒素
什么是内毒素
内毒素是革兰氏阴性菌细胞壁上的一种脂多糖(LipopolySaccharide,LPS)和蛋白的复合物,当细菌裂解时便会大量释放出来。内毒素单位为EU。
内毒素对实验影响
内毒素的存在会极大程度的影响转染效率。同时内毒素还可能激活免疫细胞的非特异反应,造成实验中的假阳性。因此,为了保证高转染率和转染细胞高存活率,必须从质粒制备的过程中将内毒素去除。
内毒素和质粒关系
由于内毒素两亲性和负电荷性,性质类似于DNA,因此在质粒纯化中会伴随质粒一同被纯化出来。
质粒中内毒素含量的高低常用EU/µg表示。按照EU/µg大小,质粒被分为三个级别:测序级别(>50EU/µg)、转染级别(<50EU/µg)和无内毒素级别(<0.1EU/µg)。
重要的事情再次强调
当你提取的质粒DNA为了转染原代细胞、悬浮细胞或者敏感细胞;进行基因沉默研究、细胞注射显微操作;进行基因治疗或者DNA疫苗等要求极为严格的实验,就应该考虑Endotoxin-Free的质粒。
2017年3月,张锋课题组在《Nature Protocols》发表的《Genome-scaleCRISPR-Cas9 knockout and transcriptional activation screening》中,Endotoxin-Free 的质粒获得被列为 Critical Step,同时推荐该厂家的NucleoBond Endotoxin Free Plasmid DNA kit,可避免病毒包装和细胞培养过程中内毒素残留的影响。
NucleoBond Endotoxin Free Plasmid DNA kit?
来自有着近百年滤纸技术和近60年色谱技术的德国MN(MACHEREY-NAGEL)。采用阴离子交换树脂技术作为质粒纯化的原理。
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推荐原因1:内毒素低于0.05EU/ug
Endotoxin-Free系列设计有的Endo-EF内毒素去除试剂,有效去除内毒素,避免了长时间的氯化铯超速离心步骤,也不需要冰上孵育30min,内毒素含量远远低于市面上同类产品。
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推荐原因2:超螺旋结构保护好
滤纸和色谱技术相结合诞生的NucleoBond Xtra Column实现裂解液重力过滤和过柱,无需离心,减少了离心力对质粒超螺旋结构的影响。
裂解后的质粒状态(泳道1)和洗脱下来的质粒状态(泳道4)是保持一致的。
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推荐原因3:抽提速度更快
NucleoBond Xtra Column实现过滤以及质粒结合树脂合二为一,避免较长时间的离心。
NucleoBond Finalizer仅需要5min即可以完成之前长达1h的异丙醇质粒离心沉淀操作。
下方是操作步骤初体验:
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推荐原因4:得率高
采用MAE作为阴离子交换树脂填料,与传统的DEAE材料(二乙氨乙基)相比,亲水性质的羟基(-OH)替代了疏水性质的甲基(-CH3),更小的分子量可以使每克树脂可结合更多的质粒DNA,得率可达1000μg。
DEAE:
MAE:
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基因有限公司作为MACHEREY-NAGEL的全国一级代理,可为您提供针对不同类型样本,例如血液、组织细胞、植物、真菌、土壤、粪便等的DNA和RNA核酸抽提解决方案。详细产品资料可留言或联系身边基因人。