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有TA，就能将DNA片段化稳稳整合到NGS全自动化流程中
近几年，高通量测序技术飞速发展，在生命科学和临床诊断各个领域都有出色的表现。二代测序（NGS）可以同时对数以万计的DNA分子进行高通量测序。在上机测序前，首先要进行文库制备，其中DNA片段化是NGS文库构建中至关重要的一步。
随着测序通量的不断提高，临床应用的不断深入，文库制备自动化和标准化流程的建立迫在眉睫。找到一个DNA片段化均一性好、片段分布集中、无碱基偏好、能够提供标准化可重复操作，且能高通量整合到NGS全自动流程中的DNA片段化设备无疑是遗传研究和诊断领域NGS实验室更大的期待。下面我们来看看ARUP Laboratories的科学家们是如何找到解决方案的。
视频中，来自ARUP Laboratories的工程师叙述了如何通过和Covaris的科学家们合作，把DNA片段化天衣无缝整合到NGS全自动化中。 Devin介绍了在诊断实验室中，DNA片段化遇到的挑战包括:不同类型的样本差异性较大、样本数量多等困难，因而在选择建立DNA片段化的自动化系统时应考虑重复性、灵活性、机械化和自动化的可能性，以及是否易于操作等因素。 LE220R-plus是Covaris专为高通量文库构建需求而设计的机型，延续了Covaris AFA技术作为NGS基因组DNA片段化金标准的所有优点，其高通量带来的灵活性和结果可重复性得到Devin团队的青睐和认可，并将其成功地整合到了NGS自动化流程中。 在国内，基因测序领域的佼佼者诺禾致源已经率先将Covaris LE220R-plus整合进自动化的文库构建体系中，极大提高了文库构建的效率。 测序行业的龙头老大illumina在文库构建过程中更是重点推荐使用Covaris进行这至关重要的一步。 NGS全自动化中不可缺少的DNA片段化模块 Covaris LE220R-Plus LE220R-plus能与自动化文库构建工作站整合，具有高通量、自动化、集成度高等特点。Covaris专为自动化设计了AFA tube，在DNA片段化后，末端修复、接头连接以及PCR反应均可在AFA tube中进行，无需样品转移，有效避免样品污染和损失。 为了实现自动化，Covaris把LE220R-plus设计为开放式的，可以与机械臂无缝衔接，实现与liquid handler的整合，另外为了安全起见，开口两边还安装了传感器，片段化过程中如操作人员不慎伸手进去，仪器会停止运行，防止意外发生。 系统配套的水浴循化系统（Water Conditioning System，WCS）能够不断过滤和更换水浴中的水，帮助去除水中污染物，保持水浴干净，降低仪器维护频率。 仪器控制软件Sonolab新添加了自动加水模块，只要仪器有连接水源，它在预约时间内自动加水、排气，控制水位，提高实验效率。 Covaris在DNA片段化过程中，既有精准可控的超声保障了无与伦比的重复性，又有良好的温控保障剪切无碱基偏好性，在150bp-5kb范围内，无论什么长度的DNA片段都可以轻松获取。可以说，Covaris超声处理系统在DNA片段化、文库构建方面的表现在业内很难被超越。 下期内容预告 Matthias Mann教授 德国马普生化研究所所长、世界著名蛋白质组学专家。蛋白质组学研究领域的大神级人物，每年都会在Nature、Cell、Science上至少发表一篇文章。2012年因在蛋白质组学和质谱研究领域的突出贡献，Matthias Mann教授荣获了影响力仅次于诺贝尔奖的Louis-Jeantet医学奖。 附相关新闻链接：https://covaris.com/press-release-univ-copenhagen-proteomics/ 基因有限公司作为Covaris公司在中国的合作伙伴及独家代理商，除了更完整的DNA 片段化解决方案，还可为您提供ChIP染色质剪切、蛋白质谱前样本制备、珍贵微量样本核酸提取及FFPE样本核酸提取解决方案等。我们有专业团队为各大科研机构提供安装培训，技术支持，应用培训与售后维护一条龙服务，赢得客户的一致好评与信任。想要了解更多信息，欢迎您联系身边的基因人，索取详细资料。
