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“安全”获得高质量的凝胶图,您也可以拥有
琼脂糖凝胶电泳分离技术是分子生物学实验室进行分离、鉴定和提纯核酸片段更常用的方法。通过在制胶时掺入或制胶后染色的方式,使荧光染料结合在核酸分子上,在特定光源的照射下便可确定核酸分子的位置。 早期,用于核酸琼脂糖凝胶染色的染料多为EB(溴化乙锭),EB可以嵌入到DNA分子碱基对之间,在紫外光的激发下发出强的荧光。EB由于其灵敏度高、稳定强而广受欢迎。但由于EB为强诱变剂,具有高致癌性,实验者在操作EB时往往“提心吊胆”。后期,EB逐渐被一些EB替代物如GoldView、GelRed、Gelsafe等所替代,此类替代物虽然毒性明显比EB降低,但操作是还是要“小心翼翼”,且大部分仍还是采用紫外光激发,实验操作者在观察凝胶尤其是切胶时还是会暴露在紫外下。我们知道紫外线照射,会导致基因突变,人体长时间接受紫外线的照射甚至会诱发皮肤癌。 有没有安全一点的成像方法呢? 当然有。蓝光成像了解一下。 蓝光成像 蓝光成像所采用的DNA结合染料更佳激发波段不再是300nm左右的紫外波段,而是集中在400-500nm左右的蓝光波段。蓝光成像相较于紫外成像具有更安全、检测灵敏度更高和对DNA无损伤等优点。 更安全 常见的蓝光染料如GeneFinder、SYBR Green等,其致突变性远低于EB数倍甚至数十倍。且此类染料更佳激发波长多是在400-500nm的可见光,检测时采用可见蓝光激发,整个凝胶检测或回收过程中操作者无需暴露在紫外下, 避免紫外对人体潜在的伤害。 灵敏度更高 常见的蓝光染料,如GeneFinder至少可检测出50pg DNA,检测核酸的灵敏度比EB染色法平均高10倍左右。SYBR Green I至少可检出20pg DNA, 灵敏度比EB染色法高10至25倍。 对DNA无损伤 紫外光会造成核酸突变、缺刻等,影响下游的PCR扩增效率、产物回收、连接转化效率(某公司曾做过实验,将1.25 kb的基因片段在紫外光下暴露2分钟,再切胶回收、连接、转化,结果发现平板上的克隆数几乎为零)、RT-PCR扩增效率等。蓝光作为一种可见光对DNA样品无任何损伤,不会影响下游实验效果。 听起来不错耶,那哪里可以买到带蓝光的凝胶成像仪呢? 找基因有限公司呀! G:BOX F3凝胶成像系统 G:BOX F3凝胶成像系统,采用500万像素高分辨率CCD检测器,F1.2电动变焦镜头,结合操作简单的图像采集软件,您可以快速获得锐利的图片。 当进行蓝光成像时您需要选择UltraBright-LED蓝光透照仪,该透照仪内含224个高强度LED灯,为成像提供高强度、均一的蓝光光源。结合蓝光染料,您不仅可以“安全”获得高质量的凝胶图,还可以“安全”的进行切胶操作。 如上PCR产物凝胶电泳图来自中山大学,GeneFinder染色,UltraBright-LED蓝光透照仪激发,G:BOX F3凝胶成像系统拍摄。