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如何从FFPE样本中获得高质量核酸？
FFPE样本日渐成为疾病分子层面研究的重要样本来源，由于FFPE样本保存过程中核酸已部分降解，同时DNA与组蛋白紧密交联，在常规的FFPE样本核酸提取过程中，可能会遇到诸多困难，比如：脱蜡的有机溶剂脱蜡效果不好；脱蜡试剂残留，干扰下游实验；样本珍贵，但抽提的核酸得率低，质量差；组织切片比较厚，难处理；提取步骤繁琐耗时等等。
那么如何解决FFPE样本核酸提取中的常见困难，获得高质量核酸呢？
主流测序平台，如三代单分子测序Pacbio、Lucigen（Illumina旗下原Epicentre），在处理FFPE样本时均推荐Covaris truXTRAC FFPE核酸提取试剂盒。
Covaris truXTRACTM基于自动聚焦声波技术（Adaptive Focused Acoustics， AFA)，其特点如下：
AFA超声乳化效果前后对比
1. 告别二甲苯等有机溶剂；
2. AFA超声乳化、脱蜡：提高水化效果和大分子解离；
3. 石蜡去除到DNA片段化<3小时，全程单管操作；
4. 更高的核酸得率和质量，可直接用于NGS；
5. 可处理5-25μm厚FFPE组织切片。
美国Roswell Park 癌症研究所Personalized Medicine中心的研究人员对Q厂家的硅胶膜过柱法和Covaris的AFA方法二者抽提的核酸样本在各大主流测序平台(如illumina、Ion torrent、PyroMark、 NanoString nCounter)上进行了验证比较。结果表明，Covaris提取的DNA样本得率和片段长度大多数优于Q厂家产品提取的；Covaris truXTRAC DNA 样本在进一步的分子诊断测试中也表现的更优。
Covaris truXTRAC FFPE DNA/RNA试剂盒在Covaris 各型号平台上均可使用。如果您已经有Covaris平台，除了核酸片段化，还可以拓展它例如FFPE样本核酸提取、Chip染色质剪切等应用；如果您暂未有Covaris平台，又面临FFPE核酸样本抽提质量不高的问题，请联系我们，我们可以为您介绍您身边的Covaris平台。
