要找到一个DNA片段化效果均一性好，集中无偏差，适合不同种类样品的DNA片段化系统，整合到NGS全自动化流程中，无疑是工程师们一大挑战。那来自ARUP Laboratories的工程师们是如何找到解决方案的呢？

视频中，来自ARUP Laboratories的工程师叙述了如何通过和Covaris的科学家们合作，把DNA片段化天衣无缝整合到NGS全自动化中。

挑战1：如何把机械臂和Covaris的DNA片段化整合起来，实现自动化？

解决方案：为了实现自动化，Covaris把LE220R-Plus设计成了开放式的，机械臂可以伸入仪器，实现与liquid handler的整合。另外为了安全起见，开口两边还安装了传感器，片段化过程中如不慎伸手进去了，机器会停止运作，以防意外发生。

图1：LE220R-Plus仪器示意图。跟其他型号不同，LE220R-Plus设计为开放式，玻璃门设有开口，可让机械臂伸入。

挑战2：如何降低仪器维护频率，把每天的仪器维护改成一个月维护一次？

解决方案：系统配套的水浴循环系统（Water Conditioning System, WCS）不断地过滤和更换水浴中的水，能帮助去除水中污染物，保持水浴干净，不用频繁换水。

挑战3：如何避免移动仪器，不用手动即让仪器自动完成储水池加水？

解决方案：仪器控制软件Sonolab新添加了一个自动加水模块，只要仪器有连接水源，它在预约时间会自动加水，排气，大约45分钟-1小时即可完成。另外水位也是通过仪器自动控制，不需肉眼判断，大大降低了人为误差。

总结：

·         在诊断实验室中，DNA片段化遇到的挑战包括不同类型的样品差异性较大，而且数量多；

·         如何成功地建立DNA片段化的自动化系统的应考虑以下因素：重复性，灵活性，机械化和自动化的可能性，和是否易于操作；

·         LE220R-Plus所提供的灵活性和结果可重复性让ARUP Laboratories把DNA片段化整合到NGS自动化中成为可能。

LE220R-Plus

NGS全自动化中不可缺少的DNA打断解决模块

图二：LE220R-Plus整合到NGS自动化流程中。

Covaris超声处理系统在DNA片段化，文库构建方面已风靡全球。Covaris采用高频率短波长的医用级别超声波，超声能量强，作用彻底。与所有传统的基于超声的样本处理方法不同，Covaris采用聚焦超声技术，仪器与样本不直接进行接触，不存在交叉污染可能。球型换能器产生的超声波可聚焦作用于样本，能量利用率，方向和力度精准可控，处理重复性好。

了解更多Covaris的NGS相关应用，请在本栏目搜索：

高通量片段化神器，测序用户的福音

LE220R-plus推荐配套耗材-oneTUBE：从DNA片段化到文库构建真正单管一体化

基因有限公司作为Covaris公司中国区独家代理商，为您提供更完整的DNA 片段化解决方案，也可为您提供ChIP实验，FFPE样本核酸提取解决方案等。基因有限公司的宗旨是“专才为专家服务”，有专业团队为各大科研机构提供安装培训，技术支持，应用培训与售后维护一条龙服务，赢得客户的一致好评与信任。想要了解更多，请关注我们的官方微信“基因快讯”或联系您身边的基因有限公司员工。