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源头破局!Covaris 重新定义 FFPE 核酸提取

版权所有,转载请联系基因市场部
2026-03-09



      FFPE 样本是肿瘤临床诊断的核心金标准,却长期被核酸提取难题困扰 —— 降解严重、回收率低、完整性差,直接制约测序质量与临床精准度。

      如何突破 FFPE 样本 DNA/RNA 提取瓶颈,让珍贵临床样本发挥最大价值?

         ---Covaris 给出了高效解决方案,从源头提升 FFPE 核酸提取效率与完整性,为肿瘤精准诊断与高通量测序筑牢关键第一步。

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01

AFA聚焦超声-脱蜡彻底



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声波能量几何聚焦

非接触式传递

稳定的样本处理温度

基于AFA技术的主动脱蜡过程

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石蜡去除效果极佳--优于传统化学方法

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02

truXTRAC自动化提取方案



     FFPE 核酸自动化提取方案,实现快速、高通量、结果稳定的核酸制备。

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truXTRAC FFPE Total NA Auto96试剂盒

▪ 高通量自动化FFPE样品提取和纯化
▪ 无需刺激性强的有毒有机溶剂
▪ 兼容FFPE蜡卷和微量FFPE样本
▪ 高品质、高得率的核酸提取
▪ 每次可提取96个样本

▪ 适配仪器:Covaris R或L系列超声仪

03

自动化方案数据展示



1

RNA/DNA的得率和纯度



      truXTRAC自动法提取的核酸得率与纯度均优于传统方法,且可实现与手动提取高度一致的效果。

1--RNA提取效果

truXTRAC自动提取和手动提取在Brain和Breast两种癌组织的RNA得率更优。

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荧光定量法(Qubit)检测FFPE组织总RNA提取得率

Auto: CVR自动化; Manual:  CVR手动法; Competitor: 传统提取法

truXTRAC自动提取和手动提取的RNA纯度更好

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230、260和280nm吸光度测定纯度(Nanodrop)


2---DNA提取效果


truXTRAC自动提取和手动提取在colon和Breast两种癌组织的DNA得率更优。

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荧光定量法(Qubit)检测FFPE组织总DNA提取得率

Auto: CVR自动化; Manual:  CVR手动法; Competitor: 传统提取法

truXTRAC自动提取和手动提取的DNA纯度与传统法相当。

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230、260和280nm吸光度测定纯度(Nanodrop)




2

RNA和DNA的质控



truXTRAC自动法提取核酸的质量均优于传统方法,且可实现与手动提取高度一致的效果。


1 RNA的可扩增性和DV200检测

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  • 图左:RT-qPCR是衡量RNA完整性(解交联,平均片段长度)的指标,truXTRAC自动和手工提取的RNA的可扩增性都优于传统试剂提取的RNA。

  • 图右:truXTRAC自动和手工提取RNA的DV200值均大于25%,可以满足RNA测序。


2 DNA的可扩增性和片段长度分析

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  • 图左:用KAPA QC试剂盒检测DNA的扩增率,三种提取方法KAPA QC值相似,说明DNA质量(长度、解交联等)相当。

  • 图右:用片段分析仪检测提取的DNA总片段长度,对于Colon组织,truXTRAC自动和手工提取的DNA长度更优。

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      利用truXTRAC和传统试剂提取的DNA进行AFA剪切测试,传统试剂提取的DNA剪切重复性较差。可能是由于不完全的解交联或洗脱的DNA含有杂质所造成。



04

自动化提取-配套设备




truXTRAC FFPE Total Auto 96 Kit 专为您的实验室设计。可以每一步都自动化,或者根据需要选择自动化步骤。

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对于完全集成自动化的流程,您还需要如下设备和试剂:

• Covaris R或L系列聚焦超声仪
• 自动化液体工作站
• 96通道全自动螺旋盖样品管开/关盖仪
• 自动化兼容离心机
• 2台液体集成处理干式加热器
• 无核酸酶水,乙醇,异丙醇

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