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提升质谱数据，深挖蛋白组学，AFA®️聚焦超声重塑蛋白样本制备新标准！
引言
样品制备对科研和临床领域的数据质量影响显著。对于蛋白质组学样品制备尤其如此，因为蛋白质组是一个极其多样化的大分子群落，浓度范围极广，且无法扩增。美国Covaris公司提供基于AFA®️(Adaptive Focused Acoustics®️)聚焦式超声技术为核心的蛋白样本制备方案，为质谱前蛋白样品制备提供准确、可重复的样品制备解决方案，以非接触式、高效蛋白提取和处理提升蛋白组学数据、提高工作效率。
爱荷华大学卡弗医学院研究团队在一项衰老对小鼠 Willis 环脑动脉蛋白质表达和相对丰度的影响研究中发现，使用Covaris AFA技术对小鼠脑组织进行裂解和蛋白提取后进行蛋白质谱分析，在CoW动脉中共鉴定到6874种蛋白质，较于之前使用探头超声提取蛋白的方法相比，新鉴定到3208种蛋白质。
德国慕尼黑工业大学生科院研究团队在一项高通量人脑蛋白组学研究中，使用R230 AFA聚焦超声系统裂解人FFPE脑组织进行蛋白提取后进行质谱分析，所有13个脑区都实现了深度蛋白质组覆盖，平均每个组织中鉴定出 9,498 种蛋白质和 98,434 种肽，所有区域共检测到 11,325 种蛋白质。比之前使用的Bioruptor水浴超声蛋白提取方法多鉴定出6000多种蛋白。
Covaris蛋白提取方案处理FFPE样本后蛋白得率和质谱数据更优
在Covaris的一项对比实验中，针对高蜡样本：只有Covaris truPREP FFPE蛋白提取试剂盒能提取出蛋白(A)；针对低蜡样本: Covaris提取相比于其它方法蛋白质得率多2.3倍(B);使用Covaris truPREP FFPE 蛋白试剂盒制备的肽, LC-MS 数据比其它方法蛋白质鉴定多12% (C)。
AFA用于新鲜冰冻和FFPE样本蛋白提取，比珠子研磨方法鉴定出更多的蛋白种类
新鲜冰冻小鼠脑、胰腺以及人FFPE肾脏10μm蜡卷，使用AFA聚焦式超声蛋白提取，与珠子研磨方法相比，质谱鉴定出的蛋白质种类更多。其中新鲜冰冻小鼠脑和胰腺分别提升19%和38%，人FFPE肾脏蜡卷提升332%。
AFA技术以极低的能量输入获得良好的处理效果，避免传统超声能量过剩可能引起的样本处理过度及热损伤，为样本处理提供高效可控、重复性优良、温度恒定及无污染处理条件。
高通量蛋白样本制备工作流程
Covaris提供自动化、标准化、高通量样本制备流程，可与其它第三方工作站(比如Agilent Bravo、Tecan等)整合，实现从FFPE、新鲜冰冻组织、细胞等初试样本到LC-MS级别注射用肽的工作流程，为用户提供高重复、高质量的蛋白组学数据。
AFA技术优势
高效温和：低能量输入，避免热损伤与处理过度，保护蛋白完整性。
高重复性：非接触式处理，结果稳定可靠，保障数据高质量。
广泛兼容性：完美适用于新鲜冰冻组织、FFPE样本、细胞等多种类型。
高通量自动化：可整合Agilent Bravo、Tecan等第三方工作站，实现无人值守的标准化流程，解放人力。
参考文献：
1.Subramanian V, Juhr D, Johnson LS et al., Changes in the Proteome of the Circle of Willis during Aging Reveal Signatures of Vascular Disease. Oxid Med Cell Longev. 2024 Jun 26;2024:4887877. doi: 10.1155/2024/4887877.
2.Johanna Tüshaus et al, A region-resolved proteomic map of the human brain enabled by high-throughput proteomics. EMBO J. 2023 Dec; 42(23): e114665.
Covaris样本制备系统针对多种样本的蛋白质谱分析开发了一站式解决方案，无论是FFPE样本、激光显微切割样本、还是细胞样本，都能帮助用户高效、稳定地获得生物大分子样本，进而协助用户提升下游实验的数据质量！Covaris公司一直致力于研发基于声学、机械及分子生物学的高性能组织样本处理系统，旨在帮助研究者实现快速、稳定、高效的样品预处理。
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关于基因 基因有限公司成立于1992年，是一家提供生命科学科研仪器、试剂耗材和技术服务的综合服务商。基于“Gene Brightens Every Life • BioTech Connects the World”——“基因燃亮生命 • 生物技术连接世界”的愿景，专注于生命科学领域前沿技术的引进和推广，致力于推动该领域国内科研机构硬件水平及实验方案的革新与升级。同时，公司也一直致力于自主品牌的科研设备的研发与生产，拥有一系列通用性强、互补性高的自主品牌产品。 基因的服务网络遍及全国各地十多个大中城市，拥有包括仪器销售，试剂销售，市场与技术支持，维修，客服，物流等多个部门组成的完整服务体系。 我们希望通过不懈努力，为您的成功铺路搭桥，也为中国的生命科学事业赶超世界先进水平尽一己之力。欲了解更多信息，请访问www.genecompany.cn。
