当前位置:首页 > 技术交流 > 最新应用



技术交流

扫描二维码
或添加“GeneGroup003
获取更多更新资讯

商城订购

扫描二维码
或添加“基因商城(GeneMart)
手机下单,快人一步

售后服务

扫描二维码
或添加“GeneGroup005
获取更快速售后支持

身材小,用途多!DS3000助力MLPA检测

版权所有,转载请联系基因市场部
2024-02-04

图片

DS3000您了解多少?

图片

——紧凑型CE一代测序仪 ——

Sanger法测序作为第一代测序技术,价格相对低廉,鉴定所需时间短,准确性高,目前仍然是作为基因检测的金标准而被广泛使用。主要应用于对突变、SNP、插入或者缺失的序列进行验证,对NGS测序结果进行验证以及对细菌、真菌、病毒、寄生虫等进行鉴定分型等。

前几次向大家介绍了①小身材,大作为!DS3000助力HID检测,②如何证明Jurkat是Jurkat?③身材小,用途多!DS3000助力过敏原检测,④身材小,用途多!DS3000助力NGS结果验证以及⑤什么?还有人不知道一代测序可以做微生物鉴定?身材小,用途多!DS3000助力MSI检测(点击查看),相信大家对日立DS3000一代测序仪在片段分析的应用有所了解。那么今天继续带大家了解DS3000在片段分析——MLPA检测的表现。



图片

#DS3000怎么进行MLPA检测#

图片


多重连接依赖探针扩增的技术 (Multiple Ligation-dependent Probe Amplification, MLPA)是一种用单一引物对扩增多达60种探针、可以同时检测多个基因组靶区域的拷贝数变异和甲基化水平的检测技术。它的基本原理是设计探针和靶序列特异型的碱基序列进行杂交,并通过连接、PCR扩增,产物通过毛细管电泳分析突变。

图片

MLPA可以用于检测由基因组缺失/重复或由表观遗传异常所导致的遗传性疾病,如造血器官肿瘤、脊髓性肌萎缩症、假性肥大型肌营养不良、Prader-Willi/Angelman综合征等。具有成本较低、灵敏度高、特异性强、操作简便等优点,只需少量的DNA样本,就可以获得可靠的结果。



图片

#DS3000如何进行MLPA检测#

图片

在本次实验中,介绍使用DS3000 测序仪对一个含有50% JAK2p.V617F突变的造血器官肿瘤样本的相关基因进行MLPA分析的数据展示。

本次样本是造血器官肿瘤之一的骨髓增生性肿瘤,包括慢性髓性白血病、慢性嗜中性粒细胞白血病、真性红细胞增多症,或真性红细胞增多症(PV)、原发性骨髓纤维化(PMF)、原发性血小板增多症(ET)、慢性嗜酸性粒细胞白血病以及不能分类的骨髓增生性肿瘤几大类,据统计≥95%的PV、ET及50%的PMF都发生了JAK2突变。基于本次DS3000分析的结果,已确认检测出预想的IKZF1,CDK6,RELN,MET,DPP6,DCC基因的重复、JAK2突变。

在检测造血器官肿瘤中发生的JAK2突变的MLPA® 分析中,使用DS3000能够正确检测所有预计的基因突变及重复。如图1和图2,JAK2探针在包含点突变 (JAK2 p.V617F) 时检测到信号,表明有突变。同时,与不含突变的参照样本(2800M Control DNA)相比,IKZF1、CDK6、RELN、MET、DPP6DCC的信号强度均为约1.5倍,并检测到重复(图2)。以上所有突变和重复均与预计的结果一致。

图片
图片

图1. 50% JAK2p.V617F突变样本的MLPA分析结果(X轴:碱基长度,Y轴:信号强度)。

在JAK2中检测到突变信号用黄色标记。

图片

图2. 50% JAK2p.V617F突变样本MLPA分析结果 (X轴:各基因,Y轴:与参照样品的信号强度比)。

注:仅限科研使用,不可用于医疗诊断及其相关用途。本资料中刊登的数据仅为测试示例,不确保数据的准确性。



结 语

图片

更多关于遗传变异分析、病原体分型,重组质粒验证以及基因编辑验证等领域的应用实例分析且看下回分解。

“小身材,大作为”

DS3000期待您的关注!


图片

图片

HITACHI公司是专业的一代测序仪生产与制造公司,其代表产品DS3000秉承日立多年来研究开发的毛细管技术与激光辐射技术成为性能优异的小型CE测序仪。基因有限公司作为HITACHI公司的特约经销商,可为感兴趣的客户提供专业的产品咨询、技术答疑、应用培训与售后维护工作等。

如果您感兴趣,欢迎添加工作人员的企业微信进行一对一沟通,也可以联系您身边的基因人。

图片


图片

关于基因

基因有限公司成立于1992年,是一家提供生命科学科研仪器、试剂耗材和技术服务的综合服务商。基于“Gene Brightens Every Life • BioTech Connects the World”——“基因燃亮生命 • 生物技术连接世界”的愿景,专注于生命科学领域前沿技术的引进和推广,致力于推动该领域国内科研机构硬件水平及实验方案的革新与升级。同时,公司也一直致力于自主品牌的科研设备的研发与生产,拥有一系列通用性强、互补性高的自主品牌产品。

基因的服务网络遍及全国各地十多个大中城市,拥有包括仪器销售,试剂销售,市场与技术支持,维修,客服,物流等多个部门组成的完整服务体系。

我们希望通过不懈努力,为您的成功铺路搭桥,也为中国的生命科学事业赶超世界先进水平尽一己之力。欲了解更多信息,请访问www.genecompany.cn

图片




欢迎关注我司“基因快讯”与“基因售后服务”官方微信

沪公网安备 31011202014103号

沪ICP备2022000693号-1