Covaris AFA揭穿病毒核酸检测阴性的假象

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Covaris AFA揭穿病毒核酸检测阴性的假象

2023-09-08

呼吸道合胞病毒(Human Respiratory Syncytial Virus, RSV)是一种RNA病毒，可导致发热、鼻炎、咽炎及上呼吸道感染等症状。一般情况下在儿童感染患者中，RSV的病毒载量(viral loads)较高，因此利用常规商业化抗原检测就容易检出。而在成年人患者中，病毒载量要低的多，为了保证检测的准确性，需要更高灵敏度的检测方法。我们与您分享一篇利用Covaris 自动声波聚焦（AFA）技术助力呼吸道合胞病毒(RSV)RNA提取并提高其检测灵敏度的文章。

实验思路

呼吸道合胞病毒（以下简称RSV病毒）的检测在临床中常用的样本有鼻拭子和痰液样本，其中痰液样本由于容易获得并且未经稀释，因此可以提供更高的灵敏度。但痰液样本的另一个特点是处理步骤复杂，难以实现高通量处理和提取。针对RSV痰液样本，本文作者比较了Covaris AFA方法与其他品牌的Glass beads研磨方法对RSV病毒核酸提取效率的影响。

作者将7个痰液样本分别使用Glass beads方法和Covaris AFA方法对样本进行破碎并进行RNA提取，采用TaqMan方法对病毒含量进行鉴定。结果显示，与Glass beads方法相比，经Covaris AFA方法处理后提取RNA的样本，通过定量PCR检测到的Ct值明显变小(变化范围1.0 - 4.0 log ，红色方框内标注),即病毒RNA的得率更高。尤其在7号样品中，使用Glass beads方法提取后，检测RSV-B呈阴性（红色椭圆形标注），而Covaris AFA方法提取后检测结果为阳性。（如下图）

由此可见，对于常规方法难以处理的样本（比如本文中的痰液样本），Covaris AFA方法可以更加高效的进行处理，保证较高的核酸得率，避免由于样本破碎不彻底等其他原因造成的假阴性检测结果，从而提高检测灵敏度。不仅如此，Covaris AFA方法的结果更稳定，重复性更好，而且Covaris还有高通量的机型可供选择，在样本处理的标准化及规模化上也有优势。

Covaris 高性能样本制备系统有多种型号供您选择！

参考文献：

Development of a real-time multiplex RSV detection assay for difficult respiratory samples, using ultrasone waves and MNAzyme technology David Nauwelaersa,∗, Leen Vijgenb, Claire Atkinsonc, Alison Toddd, Anna Maria Gerettic, Marc Van Ranste, Lieven Stuyvera. Journal of Clinical Virology 46 (2009) 238–243

Covaris公司一直致力于研发基于声学、机械及分子生物学的高性能组织样本处理系统，旨在帮助研究者实现快速、稳定、高效样品的预处理。

基因有限公司作为Covaris在中国的合作伙伴，为您提供样本前处理、DNA片段化、染色质剪切、FFPE样本核酸提取、蛋白组学等解决方案。基因有限公司的宗旨是“专才为专家服务”，有专业团队为广大客户提供安装培训，技术支持，应用培训与售后维护一条龙服务，赢得客户的一致好评与信任。想要了解更多，请关注我们的官方微信“基因快讯”或联系您身边的基因有限公司员工。