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第一个基于MAS-seq方法学的Bulk RNA测序数据现已公开
在今年年初的基因组生物学技术进展大会（AGBT）上，PacBio曾经宣布计划将MAS-Seq（程序化串联建库测序）技术扩展至16S rRNA和Bulk RNA测序应用，详情请参考之前的微信文章。
昨天我们解读了刚刚发布在《自然－生物技术》（Nature Biotechnology）上的MAS-seq方法学文献，今天我们高兴地宣布，第一个基于MAS-seq方法学的Bulk RNA测序数据现已公开，可以在这里获取：https://downloads.pacbcloud.com/public/dataset/MAS-Seq-bulk/。 接下来我们可以一起看看在Revio平台上的MAS-Seq-bulk测序的表现如何。这次检测的是人（HG002）的转录组样本，通过MAS-Seq建库 + HiFi测序，在1张Revio芯片上获得了3,873万条reads，每一条reads基本能够代表一个完整的全长转录本，通量提升非常明显。总共检测到来自22,246个基因的577,163个isoforms，每个isoform的平均长度为2.5kb。 通过饱和曲线的测算，在接近2000万条reads时检测到的基因数趋于饱和。 与标准的Iso-Seq一样，使用MAS-Seq-bulk测序同样可以发现大量目前数据库中没有的Novel isoforms。 MAS-Seq-bulk测序结果总结如下： 在1张Revio芯片上可以获得大约4,000万条reads； 数据准确率高，无需短读长测序纠错； 获得的是5'-3'的全长isoform； 提供高精度的ORF预测和可变剪接点检测； 能够识别新基因和新的可变剪接亚型； 与三级分析工具兼容（tappAS，Cerebus）用于多样本注释和差异分析。
基于MAS-seq方法学的Bulk RNA测序试剂盒按照计划将会在今年下半年正式发布。
*PacBio 产品仅供研究使用。不用于临床诊断。
基因有限公司作为PacBio公司中国区代理商，自2011年以来将PacBio第三代单分子实时测序技术引入国内，一直为国内用户提供专业的三代测序系统的安装培训，技术支持，应用培训与售后维护工作，赢得客户的一致好评与信任。基因有限公司将一如既往的支持越来越多的PacBio用户。
