EMT 依赖于细胞黏附分子表达的减少。钙粘蛋白介导钙依赖性细胞间黏附，并在正常组织发育中起关键作用。E-钙粘蛋白被认为是许多上皮癌细胞侵袭和生长的活性抑制蛋白。近期研究表明，除了 E 钙粘蛋白丢失外，癌细胞的 N-钙粘蛋白表达上调。钙粘蛋白表达变化称为“钙粘蛋白转换”，E-钙粘蛋白表达下调是 EMT 的一个标志 。

紧密连接或紧密闭合蛋白可在上皮细胞和内皮细胞之间形成一个连续的液体屏障。紧密连接可调节细胞旁通透性并维持细胞极性，阻断顶端和基底外侧细胞表面之间跨膜蛋白的运动。紧密连接由密封蛋白和闭合蛋白组成，并可与细胞骨架连接 。

封闭区蛋白 ZO-1、2 和 3（也称 TJP 1、2 和 3）是外周膜接头蛋白，可将闭合蛋白和密封蛋白等连接跨膜蛋白结合到肌动蛋白细胞骨架。ZO-1 和 -2 对紧密连接形成和功能不可或缺；ZO-1 和密封蛋白突变会诱导 EMT。

β-catenin是 Wnt 信号转导通路的关键下游效应子 ，它与脊椎动物的两个主要生物学过程有关：早期胚胎发育和肿瘤发生。β-catenin 也可激活 Slug。

Slug (SNAI2) 是一种广泛表达的转录阻遏蛋白，也是锌指转录因子 Snail 家族的一员。与相关 Snail 蛋白一样，Slug 结合 E-钙粘蛋白启动子区来抑制发育期间的转录。Slug 结合整合素启动子序列后，会抑制整合素表达、导致细胞黏附减少。

在胚胎发育的 EMT 期间，E-钙粘蛋白表达会发生下调 。ZEB 家族蛋白是包含锌指和同源盒结构域的转录因子。E-钙粘蛋白是 ZEB 蛋白所抑制的一个靶标蛋白。

基质金属蛋白酶 (MMP) 是一个蛋白酶家族，可靶向许多胞外蛋白，包括其他蛋白酶、生长因子、细胞表面受体以及黏附分子。在这些家族成员中，MMP-2、MMP-3、MMP-7 和 MMP-9 被视为胚胎发育过程、损伤修复、癌症侵袭、血管生成、致癌作用和细胞凋亡中正常组织重构的重要因子。研究已证明，MMP 活性与癌症进展有关。MMP 调节的一个机制是转录。一旦合成，MMP 以无活性酶原的形式存在。MMP 最大活性需要蛋白质组的剪切，从全长蛋白上释放抑制性前肽结构域以形成有活性的 MMP。

肌动蛋白是真核生物细胞骨架的一个主要成分。至少已发现六种脊椎动物肌动蛋白同工型。细胞浆 β 和 γ 肌动蛋白质是指“非肌肉”肌动蛋白质，因为它们主要在非肌肉细胞中表达，并且在非肌肉细胞中控制细胞结构和能动性。α 心脏和 α 骨骼肌动蛋白质分别在心脏横纹肌和骨骼横纹肌中表达。平滑肌 α 和 γ 肌动蛋白质主要分别存在于血管平滑肌和肠道平滑肌中。α 平滑肌肌动蛋白 (ACTA2) 也称为大动脉平滑肌肌动蛋白。这些肌蛋白同工型可调节肌肉细胞收缩能力。

纤连蛋白是一种多结构域细胞外基质 (ECM) 蛋白。该蛋白利用其不同的结构域结合不同的 ECM 组分（例如胶原、生长因子以及细胞表面整合素）来起作用。纤连蛋白与组织修复、纤维化和肿瘤发生等许多基本生物过程有关。纤连蛋白有许多同工型。血浆纤连蛋白由肝细胞合成，并以一种致密的失活构象存在于血流中。它是纤维蛋白凝块的一个主要组分。结合整合素或其他细胞表面受体后，纤连蛋白转换成一种延伸构象，并将其功能域暴露于激活的细胞外基质组装下。成纤维细胞、内皮细胞以及许多类型的癌细胞经证实还可合成细胞纤连蛋白同工型。其中，EDA 或 EDB 同工型在纤维化和癌症发生期间的表达特别高，因此是潜在的诊治靶标。

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