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在线研讨会预告|使用 MAS-Seq 进行单细胞全长转录组测序
单细胞 RNA 测序 (scRNA-seq) 能够表征源自复杂组织的单个细胞之间的基因表达差异,提供更高分辨率的转录组信息。 大多数单细胞实验都是使用短读长完成的。由于片段化,它们只捕获分子的各端。测序片段只能在基因水平上提供表达信息,缺少可能对疾病或生物功能十分关键的重要异构体多样性。
PacBio HiFi reads 能够对全长 RNA 异构体进行测序,还能识别单细胞条形码和 UMI 信息(图 1),在单细胞水平上揭示异构体多样性。
图 1. 使用 PacBio 长读长进行单细胞异构体测序。短读长仅能捕获基因端,缺乏异构体多样性。PacBio HiFi reads 能够以较高的准确度覆盖整个异构体,识别单细胞条形码和 UMI 信息。
在异构体水平上了解细胞异质性对于基础研究和疾病研究都至关重要。短读长只能捕获基因水平信息,而其他长读长技术识别唯一分子标签 (UMI) 和细胞条形码 (CBC) 的准确率不够。PacBio® HiFi reads 能够对全长 RNA 异构体进行测序,还能识别单细胞条形码和 UMI 信息,让我们以全新方式深入了解单细胞生物学。
使用 MAS-Seq for 10x Single Cell 3' 试剂盒处理单细胞 cDNA 可以得到一个可用于HiFi 测序的文库。与常规单细胞 Iso-Seq 文库相比,该文库可使通量提高 16 倍。
请于2022年12月6日(周二)上午11:00 - 12:00(北京时间),参加由PacBio亚太区的Minning Chin和Khi Pin Chua支持的 PacBio 亚太网络研讨会,Elizabeth Tseng、Roger Volden和Harsharan Dhillion和来自10x Genomics 的 Leo Chan也将参与其中。
通过此次在线研讨会,您将会了解到:
为什么可变剪切亚型而非基因对单细胞研究至关重要。
如何使用 MAS-Seq 方法在单细胞水平上提供高度准确的全长亚型信息,从而为疾病生物学提供突破性的见解。
如何轻松地将 MAS-Seq 集成到您的单细胞研究中,以通过文库制备演练和用户友好的信息学工作流程发现隐藏的异构体多样性。
可扫描下方二维码报名参会
讲者阵容
Elizabeth Tseng, PhD
Associate Director, Product Marketing
PacBio
Khi Pin Chua, PhD
Senior Scientist, Field Applications Support,
Bioinformatics
PacBio
Minning Chin, MSc
Staff Scientist, FAS, Asia Pacific
PacBio
Leo Chan, PhD
Senior Manager, Science and Technology Advisors, APAC
10x Genomics
Roger Volden, PhD
Bioinformatics Scientist
PacBio
Harsharan Dillion
Senior Scientist
PacBio
PacBio 产品仅供研究使用。不用于临床诊断。
基因有限公司作为PacBio公司在中国区的独家代理商,自2011年以来将PacBio第三代单分子实时测序技术引入国内,一直为国内用户提供专业的三代测序系统的安装培训,技术支持,应用培训与售后维护工作,赢得客户的一致好评与信任。基因有限公司将一如既往的支持越来越多的PacBio用户。