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细胞死亡的秘密之程序性坏死

版权所有,转载请联系基因市场部
2022-09-28

在上一节,我们了解到细胞死亡的分类、以及细胞程序性死亡经典的形式—经典的凋亡(点击回顾)。本节,我们接着说细胞程序性死亡新形式—程序性坏死(包括坏死性凋亡、焦亡、铁死亡和 NETosis)


坏死性细胞死亡信号通路

扫码查看:坏死性细胞死亡信号通路图

图片


坏死曾被经典地定义为非程序性的细胞死亡,该死亡由剧烈的化学或物理损伤所引起。可能导致此细胞意外死亡的外力包括极端的物理温度、压力、化学应力或渗透压。细胞破裂是坏死的特征,可导致细胞内含物泄漏到细胞外空间。

这会导致称为损伤相关分子模式(DAMP)的生物分子的释放,这些分子可以被免疫细胞识别并触发炎症反应。但是,最近的研究发现了几种可能触发坏死细胞死亡的调控通路。这些程序性坏死通路包括坏死性凋亡、焦亡和铁死亡。


坏死性凋亡

简介

坏死性凋亡是一种细胞自我毁灭的过程,当凋亡被另行阻止时,通过细胞外信号(死亡受体-配体结合)或细胞内信号(微生物核酸)被激活。坏死性凋亡本质上是高度免疫原性的,并且可用作抵御病原体的宿主防御机制。它还可在炎性疾病、神经退行性和癌症中被激活。


坏死性凋亡是程序性坏死细胞死亡的一种独特形式,其独立于 caspase 活性而进展。相反,它需要 MLKL 的 RIPK3 依赖性磷酸化(人类中为 Ser358,小鼠中为 Ser345)。这种磷酸化事件使 MLKL 在质膜上产生孔复合体,从而导致 DAMP 的分泌、细胞肿胀和膜破裂。


在经典通路中,在与 RIPK1 形成复合体后,RIPK3 通过在Ser227(小鼠中为 Thr231/Ser232)位点的磷酸化而被激活。可以使用磷酸化特异性抗体通过检测自身磷酸化位点(例如Ser166 和 Ser14)来监控 RIPK1 的活性。值得注意的是,RIPK1是高度调节的,并在启动 NF- κB 信号转导和存活、凋亡或坏死性凋亡的复合体中发挥作用。因此,分析关键蛋白 RIPK1、RIPK3 和 MLKL 的磷酸化状态是识别坏死性凋亡的重要步骤。此通路的其他触发因素包括 TRIF 和 ZBP-1 的病原体激活,随后与 RIPK3 相互作用并激活 RIPK3。


可以通过多种方式抑制坏死性凋亡,包括使用称为坏死抑制素的小分子直接抑制 RIPK1 活性。此外,活性 caspase-8 可通过剪切 RIPK1 和 RIPK3 来抑制坏死性凋亡。这样,caspase 驱动的凋亡通路可抑制坏死性凋亡。相反,蛋白 FLIP(caspase-8 的无催化活性的同系物)的激活可以阻止剪切 RIPK1 并导致坏死性凋亡。


研究坏死性凋亡的关键产品

• RIP (E8S7U) XP® Rabbit mAb #73271

坏死性凋亡是通过形成一种称为坏死小体的复合体而引发的,该复合体包括 RIP 激酶(RIPK1)和 RIPK3。


• Phospho-RIP (Ser166) (D1L3S) Rabbit mAb #65746

坏死信号 Z-VAD、SM164 和 TNF 诱导 RIPK1 在 Ser166 位点的自磷酸化;该磷酸化被坏死抑制素抑制。


Phospho-RIP3 (Ser227) (D6W2T) Rabbit mAb #93654

在 Ser227 位点的 RIPK3 磷酸化是通过与 RHIM 域蛋白(如 RIPK1)的相互作用来诱导的,是坏死性凋亡所必需的。


Phospho-MLKL (Ser345) (D6E3G) Rabbit mAb #37333

RIPK3 诱导的 MLKL 磷酸化触发孔形成,是坏死性凋亡所必需的。


用于研究坏死的小包装抗体套装

  • Necroptosis Antibody Sampler Kit #98110

包含:RIP (D94C12) XP® Rabbit mAb #3493,Phospho-RIP (Ser166) (D1L3S) Rabbit mAb #65746,MLKL(D2I6N) Rabbit mAb #14993,Phospho-MLKL (Ser358) (D6H3V) Rabbit mAb #91689,RIP3 (E1Z1D)

Rabbit mAb #13526,Phospho-RIP3 (Ser227) (D6W2T) Rabbit mAb #93654,Anti-rabbit IgG, HRP linked Antibody #7074


  • Mouse Reactive Necroptosis Antibody Sampler Kit #47928

包含Phospho-RIP (Ser166) (E7G6O) Rabbit mAb #53286,RIP (D94C12) XP® Rabbit mAb #3493,Phospho-RIP3 (Thr231/Ser232) (E7S1R) Rabbit mAb #91702,RIP3 (D8J3L) Rabbit mAb #15828,

Phospho-MLKL (Ser345) (D6E3G) Rabbit mAb #37333,MLKL (D6W1K) Rabbit mAb (Mouse Specific) #37705,Anti-rabbit IgG, HRP-linked Antibody #7074


焦亡

简介

焦亡是细胞死亡的一种类型,当细菌、病毒、真菌和原生动物在病原体相关分子模式(PAMP)或细胞源性 DAMP 存在下发生细胞内感染时被激活。它通常在先天免疫系统的细胞(例如单核细胞、巨噬细胞和树突状细胞)中被诱导。


焦亡的特征是 gasdermin D(GSDMD)的 N 末端剪切,导致寡聚化,从而在质膜上形成裂解孔。这种剪切过程依赖于炎症性caspase 1、4、5 和 11 的活性。监测 GSDMD 及其相关家庭成员以及这些炎症性 caspase 的剪切,是研究焦亡的关键。


经典通路通常被描述为通过两步过程发生。在第一个“启动信号”步骤中,激活 NF-κB 以诱导多种蛋白质的表达,这些蛋白质将成为炎性小体复合体的组分。炎性小体通常包含一个胞质模式识别受体 (PRR;例如 NLRP3 或 AIM2 样家族成员)、一个接头蛋白(例如 ASC/TMS1)和 pro-caspase-1。通过检测NLRP3 和可视化 ASC 斑点来分析炎性小体的激活是监测焦亡的另一种有用技术。


在第二个激活步骤中,caspase-1 被蛋白水解激活,而后剪切gasdermin D 和细胞因子 pro-IL-1β 和 pro-IL-18 ,产生其促炎症形式 IL-1β 和 IL-18,它们是由死亡细胞分泌的。可以通过使用特异性抗体来监测这些重要细胞因子的变化。一旦 GSDMD 被caspase-1 剪切形成膜孔,就会分泌细胞因子,水的流入最终会导致细胞破裂。


另外,焦亡可以被通过细胞内检测革兰氏阴性细菌 LPS 的非经典通路而诱导,从而激活 caspase-4、-5(人)和 caspase-11(小鼠)以剪切 GSDMD。


研究焦亡的关键产品

• Cleaved Caspase-1 (Asp296) (E2G2I) Rabbit mAb #89332 

Caspase-1 在典型的焦亡过程中被蛋白水解激活并被分泌到细胞外。对剪切的caspase-1 具有特异性的抗体可以用于监测焦亡。


• Cleaved Gasdermin D (Asp275) (E7H9G) Rabbit mAb #36425 

Gasdermin D 的 N 端片段是由炎症性 caspase 剪切产生的,可用于监测焦亡。


• Cleaved Gasdermin D (Asp276) (E3E3P) Rabbit mAb #10137

Gasdermin D 通过寡聚作用在质膜上形成溶孔,作为焦亡的下游效应器起关键作用。


• Cleaved-IL-1β (Asp116) (D3A3Z) Rabbit mAb #83186

IL-1β 通过 caspase-1 的剪切而被激活,并被经历焦亡的细胞分泌。


用于研究焦亡的小包装抗体套装

  • Pyroptosis Antibody Sampler Kit #43811

包含:Gasdermin D (E8G3F) Rabbit mAb #97558,Cleaved Gasdermin D (Asp275) (E7H9G) Rabbit mAb#36425,Caspase-1 (D7F10) Rabbit mAb #3866,Cleaved Caspase-1 (Asp297) (D57A2) Rabbit mAb #4199,IL-1β (D3U3E) Rabbit mAb #12703,Cleaved-IL-1β (Asp116) (D3A3Z) Rabbit mAb #83186,Caspase-4 Antibody #4450,Caspase-5 (D3G4W) Rabbit mAb #46680,HMGB1 (D3E5)Rabbit mAb #6893,Anti-rabbit IgG, HRP-linked Antibody #7074


  • Mouse Reactive Pyroptosis Antibody Sampler Kit #98303

包含:Gasdermin D (E9S1X) Rabbit mAb #39754,Cleaved Gasdermin D (Asp276) (E3E3P) Rabbit mAb#10137,IL-1β (D3H1Z) Rabbit mAb (Mouse Specific) #12507,Cleaved-IL-1β (Asp117) (E7V2A)Rabbit mAb (Mouse Specific) #63124,Caspase-1 (E2Z1C) Rabbit mAb #24232, Cleaved Caspase-1(Asp296) (E2G2) Rabbit mAb #89332, Caspase-11 (17D9) Rat mAb #14340, ASC/TMS1 (D2W8U)Rabbit mAb (Mouse Specific) #67824, HMGB1 (D3E5) Rabbit mAb #6893, Anti-rabbit IgG, HRP-linked Antibody #7074


铁死亡

简介

铁死亡是最新描述的程序性细胞死亡形式,具有独特的形态和生化特征。这是铁依赖性细胞死亡,可导致脂质过氧化物增加。因此,它主要受促进铁稳态和氧化应激的通路调节。稳态部分受铁蛋白(FTH)的调控,铁蛋白是一种大型蛋白质复合体,负责以无毒形式运输铁。铁蛋白的水平可以通过针对铁蛋白的选择性自噬过程(称为铁蛋白吞噬)来调节。该通路是由核受体共激活因子 4(NCOA4)介导的,后者是铁蛋白的选择性运输受体。已证明使用某些常见的铁螯合剂(如去铁胺)可抑制铁死亡。


调节细胞防御氧化应激的通路对于缓解铁死亡至关重要。分子亲脂性自由基清除剂(如 ferrostatin-1 和 liproxstatin-1)可以抑制铁死亡。尤其是,谷胱甘肽通路已被确定为关键的抗氧化剂防御通路。代谢蛋白谷胱甘肽过氧化物酶 4(GPX4)是这一过程的核心参与者,它可以将谷胱甘肽(GSH)转化为氧化型谷胱甘肽(GSSH),从而通过限制细胞毒性脂质过氧化作用来保护细胞抵抗铁死亡。谷胱甘肽过氧化物酶通路进一步受到 System Xc- 的调控,它是由 SLC7A11 和 SLC3A2 的异二聚体组成的氨基酸反转运蛋白,对 GSH 合成至关重要。重要的是,一种诱导铁死亡的方法是使用直接抑制 System Xc- 功能的化合物伊拉斯汀(erastin)。

涉及氧化应激的基因(包括 GPX4)的调节在很大程度上受转录因子 NRF2 的调控。这是对抗铁死亡的关键防御措施。在正常情况下,NRF2 的表达通过与 KEAP1 相互作用而受到抑制,KEAP1 是泛素 E3 连接酶复合物的一部分,可导致 NRF2 蛋白酶体降解。氧化应激会导致 KEAP1 的构象变化,从而破坏这种相互作用,因此使得 NRF2 稳定。该过程可被自噬通路进一步调节,其中自噬运输受体 p62/SQSTM1 可以竞争性地抑制KEAP1-NRF2 复合体,从而导致 NRF2 上调。

监测铁死亡的工具可能涉及多种方法,包括药理学敏感性(例如铁螯合剂,抗氧化剂)、靶标表达(GPX4、SCL7A11,铁蛋白,NRF2 等)的变化、监测活性氧和脂质过氧化以及谷胱甘肽分析。


研究铁死亡的关键产品

• Cellular Glutathione Detection Assay Kit #13859

还原型谷胱甘肽的存在对于防止由活性氧引起的细胞损伤很重要。谷胱甘肽的消耗是细胞死亡进展的指标。


• FTH1 (D1D4) Rabbit mAb #4393

铁蛋白 (FTH) 是一种普遍表达和高度保守的蛋白,通过隔离和储存离子在铁平衡中发挥主要作用。


• GPX4 Antibody #52455

谷胱甘肽过氧化物酶 4(GPX4)通过限制细胞毒性脂质过氧化作用来保护细胞免于铁死亡。


• KEAP1 (D6B12) Rabbit mAb #8047

控制氧化应激的基因调节是对抗铁死亡的关键防御蛋白。在正常情况下,NRF2 的表达通过与 KEAP1 的相互作用而受到抑制。


• NCOA4 (E8H8Z) Rabbit mAb #66849

核受体共激活因子 4(NCOA4)是一种选择性运输受体,其介导铁蛋白的水平并参与铁蛋白吞噬过程。


• NRF2 (D1Z9C) XP® Rabbit mAb #12721

在氧化或亲电应激后,NRF2 从 KEAP1 中释放,从而允许这种转录激活剂转移到细胞核并调节氧化应激反应基因。


• NRF2 (D9J1B) Rat mAb (IF Specific) #14596

该 NRF2 抗体是专门设计用于免疫荧光实验,以可视化 NRF2 在细胞内的定位。


• xCT/SLC7A11 (D2M7A) Rabbit mAb #12691

xCT/SLC7A11 是异二聚体氨基酸转运系统 x(c)(-) 的一部分,该系统调节细胞内谷胱甘肽(GSH)的水平,这对于保护细胞免受氧化应激至关重要。


用于研究铁死亡的小包装抗体套装

  • Ferroptosis Antibody Sampler Kit #29650

包含:GPX4 Antibody #52455,NCOA4 (E8H8Z) Rabbit mAb #66849,KEAP1 (D6B12) Rabbit mAb #8047,NRF2 (D1Z9C) XP® Rabbit mAb #12721,4F2hc/CD98 (D3F9D) XP® Rabbit mAb #47213,FTH1 (D1D4) Rabbit mAb #4393,xCT/SLC7A11 (D2M7A) Rabbit mAb #12691,DMT1/SLC11A2 (D3V8G) Rabbit mAb #15083,Anti-rabbit IgG, HRP-linked Antibody #7074


  • Redox Homeostasis and Signaling Antibody Sampler Kit #16815

包含:GPX1 (C8C4) Rabbit mAb #3286,GPX4 Antibody #52455,Thioredoxin 1 (C63C6) Rabbit mAb#2429,Thioredoxin 2 (D1C9L) Rabbit mAb #14907,TRXR1 (D1T3D) Rabbit mAb #15140,TXNIP(D5F3E) Rabbit mAb #14715,Prdx1 (D5G12) Rabbit mAb #8499, Phospho-Prdx1 (Tyr194)(D1T9C) Rabbit mAb #14041, Anti-rabbit IgG, HRP-linked Antibody #7074


NETosis

简介

NETosis 是一种独特的调节性细胞死亡形式,其特征是细胞膜破裂,染色质、组蛋白、颗粒和细胞质成分被挤压成网状结构,称为中性粒细胞胞外陷阱(NETs)。NETosis 被鉴定为对细菌感染的反应,可以通过脂多糖(LPS)以及炎症通路激活剂(如佛波醇12-肉豆蔻酸酯13-乙酸酯(PMA))激活。NETosis可以通过多种通路发生,但已经发现了一些关键作用因素。钙依赖性酶蛋白精氨酸脱亚氨酶 4(Protein arginine deiminase4, PAD4)催化组蛋白的超瓜氨酸化,这有助于染色质凝聚。另外,从细胞质颗粒中释放出嗜中性粒细胞弹性蛋白酶(Elastase, ELANE)和髓过氧化物酶(Myeloperoxidase, MPO)会导致细胞骨架结构的分解和组蛋白的降解。NETosis 的激活也可能在反应性活性氧(ROS)积累之后发生。NETosis 的病理学意义和潜在的治疗作用仍在研究中,但与宿主对病原体的防御以及许多疾病状态有关,包括自身免疫性疾病、血栓形成、心血管疾病和肿瘤进展。


研究 NETOSIS 的关键产品

• Myeloperoxidase (E1E7I) XP® Rabbit mAb #14569

从细胞质颗粒中释放中性粒细胞弹性蛋白酶和髓过氧化物酶(MPO)导致细胞骨架结构的分解和组蛋白的降解。


• Neutrophil Elastase (E9C9L) XP® Rabbit mAb #89241

中性粒细胞可释放中性粒细胞弹性蛋白酶、激活促炎性细胞因子并降解细胞外基质的组分,从而在介导炎症反应方面发挥重要作用。


细胞死亡通路交互作用

尽管不同的细胞死亡通路利用不同的蛋白质和细胞破坏方法,但通路之间可能会发生交互作用。TNF 受体的激活可以驱动凋亡和坏死性凋亡。类似地,RIPK1 可以参与这两种细胞死亡形式的进展。另外,已经显示出凋亡和坏死性凋亡之间的分子机制以相互排斥的方式相互调节,从而彼此连接。Caspase-8 是凋亡过程中的“启动型”蛋白,它不仅剪切蛋白以驱动凋亡,而且剪切 RIPK1 和 RIPK3 以阻止坏死性凋亡的进展。重要的是,虽然 caspase 通常被认为是凋亡的标志物,但是 caspase-1、-4 和 -5 在焦亡过程中是激活的,并在先天免疫系统中起重要作用。Caspase-3 在凋亡和焦亡过程中也是激活的。该酶可以剪切 gasdermin D,以防止孔形成和焦亡的进展。另外,最近的证据表明,caspase-3 也可以剪切 gasderminE 以激活孔复合体,这可能使焦亡随着不同剪切机制而进展。


每个通路的复杂性,以及我们对这些过程内交互作用的了解,突显出在鉴定实验中细胞死亡的形式时,需要检查多个参数的重要性。必须研究一种以上的分子通路和细胞死亡标志物,以清晰了解细胞在不同情况下如何死亡。



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