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期待已久!MERFISH超分辨率空间转录组学技术服务终于来了!

版权所有,转载请联系基因市场部
2022-09-15

超分辨率·亚细胞水平·高灵敏度

基因集团上海贝晶生物技术有限公司国内首家推出MERFISH超分辨率空间转录组学技术服务,欢迎感兴趣的研究者咨询和合作!

MERFISH:多重荧光原位杂交

(Multiplexed error-robust fluorescence in situ hybridization)


  RNA在细胞中的分布对其表达有很重要的调节作用,因此研究RNA的空间位置有很重要的意义。单分子荧光原位杂交技术(single-molecule FISH,smFISH)是进行原位基因表达检测的金标准,但其检测通量较低。

  华人科学家美国工程院院士庄小威(哈佛大学)发明了MERFISH(Multiplexed error-robust fluorescence in situ hybridization)多重荧光原位杂交技术,突破了传统的smFISH的技术通量低的缺陷,可以在单细胞中同时检测多至500种基因甚至更多。

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首家引进

MERSCOPE™超分辨率成像分析系统


  2021年,美国Vizgen公司发布了世界上第一款商品化的MERFISH超分辨率成像分析系统MERSCOPE™。2022年基因集团首家引进该平台落地上海贝晶生物技术有限公司紫竹高新技术开发区实验室。

  基于核心MERFISH技术,MERSCOPE™可对1cm²的组织进行超分辨成像,分辨率≤100纳米,定位单细胞中RNA的空间分布以及定量基因表达。实现真正意义上的原位单细胞空间基因组分析,让基因的表达和定位可视化,推动基因组学的研究步入下一代!

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MERFISH空间转录组技术的优势


1. 空间分辨率高:≤100nm分辨率,在亚细胞水平上定位RNA转录本
2. 灵敏度高:无需测序,能检测到其它方法检测不到的低表达基因
3. 高度多重:客户自定义gene panel设计,目前最多500个基因,后续会升级到1000 gene panel
4. 多样本适用性:目前适用于新鲜的/固定冰冻的超薄组织切片、细胞涂片等,短期内会实现FFPE样本方案
5. 多种应用:涉及肿瘤学、免疫学、神经生物学、感染性疾病、发育生物学&再生医学、药物开发、细胞和基因治疗等多个研究领域。
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交互式软件&可视化数据


  可视化MERFISH数据的交互式软件MERSCOPE Vizualizer™,可产生包括细胞分区分析、检测到的转录本和高分辨率图像,所得数据兼容第三方软件分析。

  专业的数据分析团队可为您提供标注特定基因的细胞群体聚类结果。

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MERFISH技术文章举例


Stogsdill, Jeffrey A et al. “Pyramidal neuron subtype diversity governs microglia states in the neocortex.” Nature(2022)


Fang, Rongxin et al. “Conservation and divergence of cortical cell organization in human and mouse revealed by MERFISH.” Science(2022)


De Luca, Roberto et al. “Orexin neurons inhibit sleep to promote arousal.” Nature communications(2022)


Zhang, Meng et al. “Spatially resolved cell atlas of the mouse primary motor cortex by MERFISH.” Nature(2021)


Favuzzi, Emilia et al. “GABA-receptive microglia selectively sculpt developing inhibitory circuits.” Cell(2021)


Lu, Yanfang et al. “Spatial transcriptome profiling by MERFISH reveals fetal liver hematopoietic stem cell niche architecture.” Cell discovery(2021)

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联系我们


  基因集团上海贝晶生物技术有限公司全国首家推出MERSCOPE™ MERFISH空间基因组学技术服务

  基因集团基因有限公司为美国Vizgen公司MERSCOPE™多重FISH超分辨率成像分析系统中国总代理

  如果您感兴趣,可以直接联系您身边的基因人。

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