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Covaris CryoPrep™ CPO2冷冻粉碎仪助力斑马鱼蛋白质组学研究
越来越多的证据表明，基因组及转录组提供的信息，并不能完整阐释复杂疾病，如癌症的发生与发展。相比基因突变，蛋白质功能活性是执行维度的信息。蛋白质是生命功能的直接体现者，因此，要了解基因的全部功能活动，最终必须回到蛋白质上来。蛋白质自身具有其特有的活动规律，如蛋白质翻译后修饰与加工，包括一级结构和高级结构的修饰、靶向运输、蛋白质间及与其他生物大分子的相互作用等。DNA水平和RNA水平的改变不足以预测蛋白质活性。因此，对蛋白质组学的研究，将有助于更好的阐释复杂疾病的发生发展、靶向治疗及预后等。在蛋白质组学研究过程中，生物样本种类繁多，在复杂样本中提取高质量的蛋白样品是影响后续分析的关键因素。 Covaris为您解忧
Covaris CryoPrep™ CP02 冷冻粉碎仪, 只需20毫秒，帮您轻松解决样本制备的难题。系统包括一个样品处理袋和一个微处理器控制的平行打击力设备，该设备利用可控的机械打击力快速地击碎封闭样品袋中冰冻的组织样品。粉粹过程仅需20毫秒，且无交叉污染，无雾性损耗。
高质量的蛋白提取 2022年美国纽约威尔康奈尔医学院团队发表在Frontiers in Cell and Developmental Biology上的研究成果，报道了H3MTs（histone3 methyltransferases）通过离散机制改变黑色素瘤的发生和进展。文中使用Covaris CryoPREP™ CP02 对斑马鱼肿瘤组织进行粉碎，然后提取蛋白质用于Western Blot分析。作者为了研究H3K9（histone 3 lysine 9）和H3K27（histone 3 lysine 27）甲基转移酶在黑色素瘤中的功能，在斑马鱼BRAF（V600E）黑色素瘤模型中构建黑素细胞表达H3.3K9M和H3.3K27M。使用该系统，发现H3K9甲基化的缺失显著抑制了黑色素瘤的形成，H3K9甲基转移酶在人类黑色素瘤细胞中的抑制增加了固有免疫反应特征。相反，H3K27甲基化的缺失显著加速了黑色素瘤的形成，并导致黑色素细胞中通常被H3K27三甲化沉默的基因解除调控。总的来说，这些数据证明了组蛋白3赖氨酸到蛋氨酸的突变如何用于揭示甲基转移酶的关键作用。 图1: H3.3K9M抑制黑色素瘤的形成。（A）miniCoopR载体策略以黑素细胞特异性方式过度表达候选基因。（B） Tg的Kaplan-Meier生存曲线（mitfa:BRAF（V600E））；tp53zdf1/zdf1；注射指示的miniCoopR结构的mitfaw2/w2斑马鱼（p值=1.81e−06根据miniCoopR H3.3和H3.3K9M之间的对数秩检验计算；本研究对12只miniCoopR H3.3和4只H3.3K9M动物进行了审查）。（C）从已建立的肿瘤中提取的酸性组蛋白的Western blot显示H3K9me3的整体缺失。 CryoPrep™ CP02作为一款Covaris针对珍贵、难处理样本推出的一款样本粉碎仪器，在蛋白组以及多组学的研究中都有着不俗的表现——使用CryoPREP在生物大分子提取前先粉碎样本，可有效保证组内样本的均质性，保障多组学巨大数据量之间的关联性和一致性。提高样本前处理水平，才能进而提高下游的实验质量。 参考文献： 1.Sara E. DiNapoli, Raúl Martinez-McFaline, Hao Shen, et al. Histone 3 Methyltransferases Alter Melanoma Initiation and Progression Through Discrete Mechanism[J]. Frontiers in Cell and Developmental Biology,2022,10:814216. 扫码关注 想了解更多详情或进行在线交流，请扫右边二维码。 基因有限公司作为Covaris公司在中国的合作伙伴和代理商，为您提供完整的质谱前处理、DNA片段化、ChIP实验、核酸提取等解决方案。基因有限公司的宗旨是“专才为专家服务”，有专业团队为各大科研机构提供安装培训，技术支持，应用培训与售后维护一条龙服务，赢得客户的一致好评与信任。想要了解更多，请关注我们的官方微信“基因快讯”或联系您身边的基因有限公司员工。
