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PacBio每周文献导览(2022-40)

版权所有,转载请联系基因市场部
2022-10-10

人类巨细胞病毒株的多样性和动力学揭示供体肺是移植后的主要贡献者

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doi: https://doi.org/10.1093/ve/veac076


混合人类巨细胞病毒 (HCMV) 毒株感染在肺移植受者 (LTR) 中很常见。迄今为止,供体 (D) 和受体 (R) HCMV 血清状态对移植后宿主内 HCMV 毒株组成和病毒种群动态的影响知之甚少。在这项研究中,研究人员使用靶向 PacBio 测序来确定宿主内病毒株的多样性。


通过 plyNCR 标记的单分子实时 (SMRT) 测序的菌株水平分辨率和肺炎球菌携带动力学:瑞士婴儿的纵向队列研究

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doi: https://doi.org/10.1186/s40168-022-01344-6


研究人员对 872 个婴儿鼻拭子样本使用 PacBio 扩增子测序以解决菌株分离问题,在 18% 的样本中鉴定出两种或多种肺炎链球菌菌株。



其它文献 - 动植物

杀鲑螺核的染色体尺度参考基因组

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doi: https://doi.org/10.1038/s41597-022-01703-w


使用 PacBio 和 Hi-C 技术进行草莓染色体水平基因组组装

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doi: https://doi.org/10.3389/fgene.2022.873711


爪哇长臂猿(Hylobates moloch)的全基因组序列和组装

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doi: https://doi.org/10.1093/jhered/esac043


全长转录组测序和时间转录组表达谱分析提供了对艾蒿中萜类生物合成的见解

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doi: https://doi.org/10.3390/molecules27185948


转录组测序和代谢组分析揭示小米干旱胁迫的分子机制

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doi:  https://doi.org/10.3390/ijms231810792


沙鼠新染色体的起源

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doi:https://doi.org/10.1101/2022.09.21.508825


多DNA病毒在寄生过程中的体细胞染色体整合引发了它们在多个鳞翅目科中的种系浸润

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doi: https://doi.org/10.1101/2022.09.22.509082


内共生体收获:来自达尔文生命之树生物多样性基因组学项目的 Wolbachia 基因组的系统基因组分析

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doi: https://doi.org/10.1101/2022.09.20.508647


图构建方法影响牛超级泛基因组中的变异表示和分析

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doi: https://doi.org/10.1101/2022.09.17.508368


水紫藤的染色体水平基因组建立了生态植物模型,并提供了对两栖植物异质性分子机制的深入了解

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doi: https://doi.org/10.1101/2022.09.19.508473



其它文献 - 微生物

揭示常见肠道原生生物的系统发育:Endolimax 的属内多样性

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doi: https://doi.org/10.1016/j.protis.2022.125908


中国猪耐多药肺炎克雷伯菌 200 中新型 IncHI1B 质粒的鉴定

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doi: https://doi.org/10.3390/antibiotics11091225


从城市淡水溪流中分离出的Pantoea sp. Strain SOD02

菌株的染色体和质粒序列

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DOI: https://doi.org/10.1128/mra.00822-22


能够降解聚乙烯的细菌 Cupriavidus campinensis G5 菌株的基因组序列

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https://doi.org/10.1128/mra.00553-22


一种罕见血清型肠沙门氏菌血清型穆阿林血清的致病特征和基因组分析

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doi: 10.7754/Clin.Lab.2021.211130


高海拔药用地衣长松萝相关的内生细菌和真菌微生物群的多样性

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https://doi.org/10.3389/fmicb.2022.958917


炭疽菌真菌对单子叶植物和真双子叶植物适应的基因组进化和转录组可塑性

doi: https://doi.org/10.1101/2022.09.22.508453


多DNA病毒在寄生过程中的体细胞染色体整合引发了它们在多个鳞翅目科中的种系浸润

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doi: https://doi.org/10.1101/2022.09.22.509082


食草动物影响溶解的储存聚糖的组成,从而影响双相北海春季藻类开花期间的浮游细菌组成

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doi: https://doi.org/10.1101/2022.09.22.509014


SARS-CoV-2 Omicron BA.1 和 BA.2 受体结合域中 ACE2 结合、RBD 表达和抗体逃逸的深度突变扫描

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doi: https://doi.org/10.1101/2022.09.20.508745



PacBio SMRT测序只用于科研,不用于临床。


      基因有限公司作为PacBio公司在中国区的独家代理商,自2011年以来将PacBio第三代单分子实时测序技术引入国内,一直为国内用户提供专业的三代测序系统的安装培训,技术支持,应用培训与售后维护工作,赢得客户的一致好评与信任。基因有限公司将一如既往的支持越来越多的PacBio用户。




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