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PacBio每周文献导览（2022-35）
体内单分子分析揭示 COOLAIR RNA 结构多样性
doi: https://doi.org/10.1038/s41586-022-05135-9
新的 RNA 结构分析方法（称为 smStructure-seq）来“确定单个 RNA 分子的体内结构，而不是 RNA 群体的平均值。这表明 COOLAIR 转录本的各个亚型采用具有不同构象动力学的多种结构。” 该方法在概念上类似于用于 DNA 染色质分析的 Fiber-Seq/SAMOSA：在这里，组织暴露于修饰单链 RNA 碱基的化学试剂，这会导致生成的 cDNA 发生突变，从而可以使用 Iso-Seq 准确检测RNA的全长。
这反过来允许确定不同 isoform 的 RNA 构象。据我们所知，这是 PacBio 测序的全新用途。
其它文献 - 人类医学 异源人类近端着丝粒染色体之间的重组 doi: https://doi.org/10.1101/2022.08.15.504037 基于单分子长读长实时扩增子的 CYP2D6 测序：具有混合单倍型的概念验证 doi: https://doi.org/10.1101/2022.08.17.503990 Aldy 4：药物基因组学的高效基因分型器和 star-allele caller doi: https://doi.org/10.1101/2022.08.11.503701 人类卫星 1 (HSAT1) 分析提供了着丝粒周围转录的新证据 doi：https://doi.org/10.1101/2022.08.11.503625 PacBio SMRT 和Illumina RNA-seq的整合分析揭示了P450基因与Bradysia odoriphaga的噻虫嗪解毒有关 https://doi.org/10.1016/j.pestbp.2022.105176
其它文献 - 动植物 一个新的单倍型解析火鸡基因组，使火鸡的遗传学和基因组学研究成为可能 doi: https://doi.org/10.1101/2022.08.06.503030 Lactarius hatsudake 的高质量基因组组装 doi: https://doi.org/10.1101/2022.08.15.504028 唯一非南极冰鱼的次温带适应的基因组学 doi: https://doi.org/10.1101/2022.08.13.503862 Heliconiini 蝴蝶适应性辐射过程中基因组大小和含量的进化动态 doi: https://doi.org/10.1101/2022.08.12.503723 动物线粒体基因组的单分子测序揭示了叶绿体样结构和重复介导的重组 doi: https://doi.org/10.1101/2022.08.11.503648 基于染色体的雀稗基因组为盐胁迫适应提供了新的见解 doi：https://doi.org/10.1101/2022.08.08.503172 拓扑复杂的细胞质可以实现基于膨胀的重力陷阱逃逸 doi: https://doi.org/10.1101/2022.08.19.504465 用于长读长和长距离测序的超高分子量 DNA 保存方法的基准测试 https://doi.org/10.1093/gigascience/giac068
其它文献 - 微生物 艰难梭菌 PCR 核糖型 151 是多系的，包括来自隐秘进化枝 C-II 的致病性分离物，具有可以逃避常规诊断的单毒素致病性基因座 doi: https://doi.org/10.1101/2022.08.17.504118 大西洋水流入和海冰覆盖的变化推动了北极海洋细菌群落的分类和功能变化 DOI: https://doi.org/10.1101/2022.08.12.503524 从城市淡水溪流中分离的气单胞菌 SOD01 的完整基因组 doi: https://doi.org/10.1128/mra.00673-22 全基因组分析指导从李梅果实糖浆中分离的酵母降解氰苷的分子机制 DOI: https://doi.org/10.1016/j.chemosphere.2022.136061 第一种真菌来源的根瘤菌的分离、基因组特征和蘑菇生长促进作用 DOI: https://doi.org/10.3389/fmicb.2022.947687 唾液乳杆菌 AR809 的完整基因组序列，一种具有口咽道抗性和口腔上皮细胞粘附性的益生菌菌株 https://doi.org/10.1007/s00284-022-02963-w 极抗辐射菌株乌鲁木齐异球菌 R12 的完整基因组测序分析 https://doi.org/10.1007/s00284-022-02984-5 中国整合共轭元件携带bla IMP-1的一株临床君腾假单胞菌 https://doi.org/10.3389/fmicb.2022.929800 Bacillus velezensis SYL-3通过调节叶际微生物群落抑制感染烟草的链格孢和烟草花叶病毒 https://doi.org/10.3389/fmicb.2022.840318
PacBio SMRT测序只用于科研，不用于临床。
基因有限公司作为PacBio公司在中国区的独家代理商，自2011年以来将PacBio第三代单分子实时测序技术引入国内，一直为国内用户提供专业的三代测序系统的安装培训，技术支持，应用培训与售后维护工作，赢得客户的一致好评与信任。基因有限公司将一如既往的支持越来越多的PacBio用户。
